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拟南芥基因组测序 主讲人：xxx 组员：xxx，xx，xxx， xx 拟南芥（Arabidopsis thaliana） 界：植物界 门：被子植物门 纲：双子叶植物纲 目：白花菜目 科：十字花科 属：拟南芥属 种：拟南芥 拟南芥特点 拟南芥研究历史 拟南芥研究历史 Laibach在他之后的工作中大力推动了对拟南芥的研究。并和其他科学家一起促成了1965年在德国哥廷根召开的第一届国际拟南芥会议。现在，这个会议已发展成国际拟南芥研究的一项科学盛事 。2007 年首次在我国首都北京召开。 拟南芥研究历史 First International Symposium on Arabidopsis Research in Go¨ttingen, April 21–24, 1965. 拟南芥研究历史 Second International Symposium on Arabidopsis Research in Frankfurt am Main, September 13–15, 1976 拟南芥研究历史 拟南芥研究历史 1986年，Meyerowitz 实验室首次报道了对拟南芥中一个基因的克隆. 拟南芥研究历史 1988 年，Meyerowitz 实验室发表了拟南芥基因组的首个 RFLP 图谱。 拟南芥研究历史 在之后的几年中，在Plant Cell，Science等杂志上相继报道了 T-DNA 插入突变基因的克隆、基于基因组图谱的基因克隆。 这些突破使人们逐渐认识到拟南芥作为实验材料对植物生命进行探索的价值。 拟南芥基因组计划 1996 年, 由美国、欧洲和日本等几十家实验室参加的国际大合作拟南芥基因组全序列测定项目启动。 在2000年底，这项计划已顺利完成。 拟南芥基因组计划 在2000 年12月4日英国出版的NATURE杂志上（Vol.408：796~815 ），发表了植物分子遗传研究的模式开花植物拟南芥 115.4Mb的全序列图谱。 拟南芥基因组计划 测序结果: 只剩下10Mb的中心着丝区DNA，因为多重复序列所含基因很少，还未全测出。 包含25498个功能基因组及其所对应的 11000个蛋白质家族。 这是人类首次全部破译出一种高等植物的全基因序列。 拟南芥基因组计划 Representation of the Arabidopsis chromosomes 红色是已测序部分 浅蓝色是端粒和着丝粒区域 黑色是异染色质区域 粉红色是rDNA重复区域 Summary statistics of the Arabidopsis genome Functional analysis of Arabidopsis genes Proportion of predicted Arabidopsis genes in different functional categories Functional analysis of Arabidopsis genes Comparison of functional categories between organisms 拟南芥基因组测序历史 拟南芥5 条染色体中2号,4号染色体已经在 1999年测序完毕，原文在1999年 12月16日出版的NATURE杂志上刊载。这一次在公布整个基因组序列的分析报告的同时，在同期也以相似的标题分别发表了1号、3 号、5 号染色体的序列及其分析（Vol.408:816~826）。 拟南芥基因组测序历史 拟南芥基因组测序历史 拟南芥基因组测序历史 拟南芥基因组测序历史 拟南芥基因组测序历史 现在人们在世界各地共收集到 750 多个拟南芥生态型，这些生态型在形态发育、生理反应方面存在很大差异。在拟南芥的众多生态型中最常用的三种是 Landsberg erecta(Ler)、Columbia(Col)、Wassilewskija(Ws)，其中 Col 生态型用于拟南芥的全基因组测序。 拟南芥基因组测序历史 拟南芥基因组测序历史 / 拟南芥基因组测序历史 拟南芥基因组测序历史 中国贡献 中国国家自然科学基金委员会已于2001年快速启动“拟南芥全部转录调控因子蛋白组学研究”重大国际合作研究项目，2004年3月，研究取得了重要进展：共克隆了44个拟南芥转录调控因子家族中的1282个基因，获得了拟南芥所有已知和预测的1864个转录因子的序列。是世界上获得转录因子基因最多最完整的国家。 拟南芥基因组测序意义 能够更详尽的了解植物独特的代谢过程,。 了解植物与环境的相互作用以及它们的抗病和抗虫能力。 由于许多生理生化过程是十分保守的。因此可通过基因及基因功能比较, 跨种甚至跨界的揭示生命活动的基本规律。 有助于理解DNA 的复制和染色体的分离过程, 并为基因工