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主成分分析的计算步骤
样本观测数据矩阵为:
x11
x12
x1 p
X
x21
x22
x2p
xn1
xn2
xnp
第一步:对原始数据进行标准化处理
* xijxij x
* xij
xij xj
var(Xj )
(i
1,2,
,n;j 1,2, ,p)
其中xj
其中
xj
1 n
-xij
n i 1
第二步:为方便,var(Xj)(Xij12 xj)计算样本相关系数矩阵假定原始数据标准化后仍用(j1,2,
第二步:
为方便,
var(Xj)
(Xij
1
2 xj)
计算样本相关系数矩阵
假定原始数据标准化后仍用
(j
1,2,
,P)
r12
「1p
rp2
r
1 pp
X表示,
则经标准化处理后的数据的相关系数为
1r
1
r
1 j ?
n 1
n
xti xtj t 1
(i,j 1,2, , P)
第三步:用雅克比方法求相关系数矩阵 R的特征值(1
第三步:
用雅克比方法求相关系数矩阵 R的特征值(
1, 2 p)和相应的特征向量
ai ai1, ai2, aip , i 1,2
P。
第四步:选择重要的主成分,并写出主成分表达式
主成分分析可以得到 p个主成分,但是,由于各个主成分的方差是递减的,包含的信
息量也是递减的,所以实际分析时,一般不是选取p
息量也是递减的,所以实际分析时,一般不是选取
p个主成分,而是根据各个主成分累计
贡献率的大小选取前 k个主成分,这里贡献率就是指某个主成分的方差占全部方差的比重,
实际也就是某个特征值占全部特征值合计的比重。即
贡献率=——i—p
i 1
贡献率越大,说明该主成分所包含的原始变量的信息越强。 主成分个数k的选取,主要
根据主成分的累积贡献率来决定,即一般要求累计贡献率达到 85%^±,这样才能保证综合
变量能包括原始变量的绝大多数信息。
另外,在实际应用中,选择了重要的主成分后,还要注意主成分实际含义解释。主成分
分析中一个很关键的问题是如何给主成分赋予新的意义, 给出合理的解释。 一般而言,这个
解释是根据主成分表达式的系数结合定性分析来进行的。 主成分是原来变量的线性组合, 在
这个线性组合中个变量的系数有大有小, 有正有负,有的大小相当,因而不能简单地认为这
个主成分是某个原变量的属性的作用, 线性组合中各变量系数的绝对值大者表明该主成分主
要综合了绝对值大的变量, 有几个变量系数大小相当时, 应认为这一主成分是这几个变量的
总和,这几个变量综合在一起应赋予怎样的实际意义, 这要结合具体实际问题和专业, 给出
恰当的解释,进而才能达到深刻分析的目的。
第五步:计算主成分得分
根据标准化的原始数据,按照各个样品,分别代入主成分表达式,就可以得到各主成分 下的各个样品的新数据,即为主成分得分。具体形式可如下。
Fil F12 Fik
F21 F22 F2k
Fn1
Fn1 Fn2
Fnk
第六步:依据主成分得分的数据,则可以进行进一步的统计分析 其中,常见的应用有主成份回归,变量子集合的选择,综合评价等。
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