分子动力学结果分析.pptxVIP

分子动力学结果分析;１ 平均值;微观领域往往研究单个粒子的行为 ， 宏观性质是大量粒子的综合行为。 分子动力学（MD）方法能够再现宏观行为 ， 同时又存储了大量的微观信息 ， 因此是联系宏观和微观的重要工具。 利用此方法可以研究由热力学统计物理能够给出的各种性能参数。 统计力学将系统的微观量与宏观量通过统计物理联系起来。;在分子动力学中 ， 使用了时间平均等于系统平均的各态历经假设 ， 即;　 温度 T;能　 量;压力 P;实际体系的虚功为理想气体的虚功与粒子之间相互作用部分的虚功的和 ， 即;第9页，共31页。;径向分布函数;径向分布函数 g（r）是距离一个原子为 r时找到另一个原子的概率 ， g（r）是一个量纲为 １的量。 如果在半径 r到 r ＋ δr的球壳内的粒子数为 n（r） ， 由此可以得到径向分布函数 g（r）为;第12页，共31页。;第13页，共31页。;第14页，共31页。;第15页，共31页。;第16页，共31页。;第17页，共31页。;第18页，共31页。;第19页，共31页。;第20页，共31页。;静态结构因子;热力学性质;NVT;动力学性质;如果?x?和?y?是不同的物理量 ， 则关联函数称为交叉关联函数（cross-correlation function) 如果?x?和?y?是同一量 ， 则关联函数称为自关联函数（autocorrelation function） 。;归一化的速度自关联函数为;2 　 输运性质;扩散行为随时间的演化由 Fick 第二定律来描述 ， 即;当模拟的材料为纯的材料时 ， 扩散系数被称为自扩散系数。 扩散系数与平均平方位移有关。由爱因斯坦关系知 ， 平均平方位移等于 ２Dt ， 在 三维情况下 ，;剪切粘滞系数;Diffusivity Shear viscosity Thermal conductivity