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目录
摘 要I
AbstractIII
目录V
第1章 绪论1
1.1 土壤铬污染现状1
1.2 土壤污染修复技术现状1
1.2.1 微生物修复技术1
1.2.2 微生物修复在土壤铬污染的应用现状2
1.3 假单胞菌在修复土壤重金属污染的应用2
1.4 研究意义与内容3
1.4.1 研究意义与目的3
1.4.2 研究主要内容4
1.4.3 技术路线5
第2章 假单胞菌Cr13在六价铬胁迫下的转录组分析6
2.1 材料与方法6
2.1.1 实验材料6
2.1.2 主要试剂6
2.1.3 实验仪器6
2.1.4 菌液制备及测序6
2.1.5 总RNA的提取和反转录反应6
2.1.6 差异表达基因的荧光定量PCR7
2.2 铬胁迫响应相关基因测序结果8
2.2.1 测序结果的统计与拼接8
2.2.2 功能注释与分类9
2.2.3GO功能分类注释9
2.2.4 COG功能分类注释10
2.2.5KEGG分类10
2.2.6Cr （VI）胁迫下的差异表达基因11
2.2.7KEGG途径富集的DEGs 12
2.2.8 差异表达基因的荧光定量PCR12
2.3 讨论13
2.4 小结14
3 Cr13 SoxR 15
第 章 假单胞菌 基因工程菌株的构建
V
3.1材料与方法 15
3.1.1 实验材料15
3.1.2 主要仪器15
3.1.3 实验试剂16
3.1.4 假单胞菌基因组DNA的获取16
3.1.5Cr13菌株四个基因未知片段的PCR扩增16
3.1.6 连接及转化实验18
3.1.7 PCR 19
菌液 的验证
3.1.8SoxR转基因载体的构建20
3.2 结果与分析25
3.2.1 SoxR PCR 25
目的基因 全长 扩增结果
3.2.2 SoxR工程菌株的构建26
3.3 讨论28
3.4 小结28
第4章 假单胞菌工程菌和野生菌生理生化特性的差异29
4.1 材料与方法29
4.1.1 实验材料29
4.1.2 主要仪器29
4.1.3 测定菌株的生长曲线29
4.1.4 测定菌株的转化铬能力29
4.1.5 菌株氧化应激能力的测定29
4.1.6 菌株胞外聚合物含量的测定31
4.1.7 胞外聚合物中多糖浓度测定31
4.1.8 菌株脂质过氧化产物的测定31
4.2 结果与分析31
4.2.1 菌株的生长曲线31
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