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分子生物学生物信息传递上;● 基本概念
● 转录起始: RNA聚合酶、启动子
● 转录的基本过程
● 转录后加工
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● RNA合成与DNA合成异同点
;一、基本概念;◆ RNA主要以单链的形式存在
◆转录后得到的RNA要经过加工才能变成成熟的mRNA
◆ 转录产物还可以变为rRNA和tRNA。;参与转录的物质;
;;无论在原核还是真核细胞中,RNA链的合成都具有以下几个特点:;转录的不对称性:;;;● 基本概念
● 转录起始: RNA聚合酶、启动子
● 转录的基本过程
● 转录后加工
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● RNA合成与DNA合成异同点
;二、参与转录起始的关键酶与元件转录机器(p69)即是转录复合物,其最核心成分是RNA聚合酶。;全酶=核心酶+ σ亚基 (大肠杆菌为例);大肠杆菌RNA聚合酶的组成分析;● 真核生物RNA聚合酶;RNA polymerase II (RNA 聚合酶II);
在转录的不同阶段,RNA聚合酶将同DNA结合,形成不同的复合物:
在识别阶段,聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭二元复合物。
接着,结合处DNA双链解开,封闭复合物变为开放二元复合物。
转录开始,由RNA聚合酶、DNA和新生RNA形成三元复合物。;转录因子(transcription factor);全酶=核心酶+ σ因子;(二) 启动子(promoter);几个基本概念;上游序列(upstream):转录起点前面,即5‘端的序列
下游序列(downstream):转录起点后面,即3’端的序列
描述碱基位置时,起点为+1,下游方向依次为+2,+3.。。。
上游方向依次为-1,-2,-3.。。。。;1. 启动子区的基本结构
原核生物中经对启动子的比较,它们有共有序列:
在上游10bp处为TATAAT,又称为Pribnow盒
在上游35bp处为TTGACA。
;;大肠杆菌RNA聚合酶全酶所识别的启动子区;真核生物启动子的结构;1、核心启动子;2、上游启动子元件;-10区与-35区的最佳距离
原核生物中, -10区与-35区之间的距离大约是16~19bp,小于15bp或大于19bp都会降低启动子的活性。
细菌中常见的两种突变:
下降突变:使结构基因转录水平下降
上升突变:提高结构基因的转录水平;5. 增强子及其功能
增强子(enhancer):能提???转录起始效率的序列被称为增强子or强化子。;增强子的特点(p80):
远距离效应。一般位于上游-200bp处。
无方向性。可位于靶基因的上游、下游或内部。
顺式调节。只调节位于同一染色体上的靶基因。
无物种和基因特异性。可连接到异源基因上发挥作用。
有组织特异性。需要特定的蛋白因子参与。
有相位性。其作用与DNA的构想有关。
有的增强子可以对外部信号产生反应。;6. 转录的抑制
转录抑制剂根据其作用性质主要可以分为两大类:
DNA模板功能抑制剂,与DNA结合而改变模板的功能。
RNA聚合酶抑制剂,与RNA聚合酶结合而抑制其活力。
除上述抑制剂外,还有一些嘌呤和嘧啶的类似物,如5-氟尿嘧啶等,可以作为核苷酸代谢拮抗物来抑制核酸前体的合成。;● 基本概念
● 转录起始: RNA聚合酶、启动子
● 转录的基本过程
● 转录后加工
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● RNA合成与DNA合成异同点
;三、转录的基本过程;2. 转录起始
RNA聚合酶结合到启动子上以后,使启动子附近的DNA解旋并解链,形成转录泡以促使核糖核苷酸与模板DNA配对。
转录起始即是RNA链上第一个核苷酸链的产生。
无需引物。
起始后直到形成9个核苷酸的过程是通过启动子阶段,此时RNA聚合酶一直在启动子处,之后进入正常延伸。
;3. 转录延伸
转录延伸即是RNA聚合酶释放σ因子离开启动子后,核心酶沿着模板DNA移动并使新生RNA链不断伸长的过程。
4. 转录终止
当RNA链延伸到终止位点时,RNA将停止合成,转录泡瓦解,DNA链复原,新生RNA链和RNA聚合酶将被释放下来。这即是转录终止。;4、转录终止;1. 不依赖于ρ因子的终止;不依赖?因子的终止(p91); 终止效率与GC二重对称序列和寡聚U的长短有关,长度 效率 ;依赖?因子的终止有些终止点的DNA序列缺乏共性,不能诱导转录的自发终止,需要ρ因子的参与。;“穷追”模型(hot pursuit)
;● 基本概念
● 转录起始: RNA聚合酶、启动子
● 转录的基本过程
● 转录后加工
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● RNA合成与DNA合成异同点
;四、转录后加工
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