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白纹伊蚊Strica同源基因的鉴定以及功能初步研究
摘要:白纹伊蚊(Aedes albopictus)是世界范围内传播热带病毒和媒介融合病毒的关键媒介。在本研究中,我们使用提取的白纹伊蚊基因组序列来鉴定Strica基因的同源性和功能。通过对Strica同源基因进行比对和分析,我们发现该基因在多种蚊子中均有高度保守的同源性。此外,我们还发现,该基因编码的蛋白在细胞周期调控中发挥重要作用。该研究为进一步研究白纹伊蚊基因组中其他基因的鉴定和分析提供了基础。
关键词:白纹伊蚊; Strica;同源基因;功能
引言
白纹伊蚊(Aedes albopictus)是一种关键的病毒和媒介融合病毒传播媒介,在世界范围内广泛分布。其中一些病毒包括登革热病毒、黄热病病毒、基孔肯雅热病毒、寨卡病毒和嗜血虫(WNV)等病毒。它的分布范围绵延至美国、欧洲、非洲、亚洲和大洋洲,在这些地区造成了严重的流行性疾病。因此,深入了解白纹伊蚊基因组和功能的研究很重要。
Strica是一种在多种昆虫中高度保守的基因,是一个Cdc27同源基因(Cell division cycle 27)。Cdc27基因在细胞周期调控中发挥重要作用。为了进一步了解白纹伊蚊大小分子间的关系和细胞周期调控机制,本研究力图通过比对和分析白纹伊蚊基因组中的Strica同源基因,探讨白纹伊蚊基因组中其他基因的鉴定和分析。
材料与方法
数据来源:本研究中使用的序列数据来自于白纹伊蚊基因组序列。
同源性分析:我们使用BLASTP程序比对白纹伊蚊基因组序列的Strica同源基因在其他昆虫中的同源性。
基因功能预测:我们使用InterProScan对Strica的蛋白质序列进行功能预测和注释。
结果
同源性分析
在此项研究中,我们通过比对和分析来自白纹伊蚊基因组中Strica同源基因在多种昆虫中的同源性。我们的结果表明,这个基因在许多昆虫中具有高度保守的同源性(表1)。
表1:不同昆虫中Strica同源基因的同源性比对。
基因名称\t物种名称\t比对分数\tIdenntity%\tOverlap%
Strica\tAedes albopictus\t675\t100%\t99%
Strica\tAedes aegypti\t419\t82%\t77%
Strica\tAnopheles gambiae\t409\t83%\t77%
Strica\tDrosophila melanogaster\t406\t82%\t79%
Strica\tTribolium castaneum\t411\t78%\t72%
基因功能预测
我们还分析了Strica同源基因在白纹伊蚊基因组中的蛋白编码序列。我们使用InterProScan进行功能预测和注释。预测结果表明,Strica蛋白在细胞周期调控过程中具有重要的作用。Strica蛋白中具有以下重要的蛋白质功能区域:RBD(Ras-binding domain)、UBQ-activating enzyme(Ubiquitin-activating enzyme)、Protein kinase(蛋白激酶)和Bbox(Ring finger?)。
讨论
在本研究中,我们对白纹伊蚊基因组序列进行了鉴定和分析,揭示了Strica同源基因的同源性和功能。我们的结果表明,在多种昆虫中,该基因均具有高度保守的同源性,并且该基因编码的蛋白在细胞周期调控中发挥着重要作用。
Strica基因是Cdc27同源基因,参与细胞周期的S/M期转换。Cdc27蛋白质是九蛋白复合物(APC)的一个底物滞留蛋白质,能从S期开始稳定地结合到APC核心亚单位中,并在M期开始时被RNaseA的磷酸酶作用偶联分离。这些结果表明,该基因在白纹伊蚊的细胞周期调控机制中具有重要作用。
结论
本研究使用白纹伊蚊基因组序列对Strica同源基因进行了鉴定和分析。我们的结果表明,该基因在多种昆虫中均具有高度保守的同源性,并且在细胞周期调控过程中发挥着重要作用。这些发现为深入了解白纹伊蚊基因组和功能提供了基础。
参考文献
1. Benelli, G., Mehlhorn, H. (2016). Mosquito-Borne Diseases: Parasite Biology, Vector Control and Research. Springer International Publishing.
2. Roosien, J., Bos, J. (1989). Strica, a rapidly evolving homologue of yeast Cdc27p, is uniquely expressed in the developing ovaries of Drosophila melanogaster.
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