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溴化氰断裂法: 当前第30页\共有48页\编于星期五\2点 羟胺断裂法:断裂Asn-Gly之间的肽键,但专一性不强,也可以断裂Asn-Leu和Asn-Ala之间的键。 当前第31页\共有48页\编于星期五\2点 六、肽段氨基酸序列的测定 (一)Edman化学降解法 用此原理已制成蛋白质序列分析仪。若每次循环的准确度为99%,经60次循环,准确度为:0.9960=0.54。 当前第32页\共有48页\编于星期五\2点 (二)降解法 可用氨肽酶和羧肽酶,只能测出末端的几个氨基酸。羧肽酶Y可作用于任何氨基酸,有可能以此为基础开发出新的氨基酸的顺序测定仪。 (三)根据核苷酸序列推定法 分离mRNA,经反转录测定cDNA的核苷酸序列,再用遗传密码推定氨基酸序列。 当前第33页\共有48页\编于星期五\2点 (四)质谱法 可分析微量的肽链,短肽在第一台质谱仪中经电喷射电离,按荷质比分离,依次在经碰撞池被裂解成离子碎片,在第二台质谱仪中测出各个离子碎片的谱线,推算出短肽的氨基酸序列。在蛋白质组学中应用广泛,但不能区分亮氨酸和异亮氨酸。 当前第34页\共有48页\编于星期五\2点 * * 第四章 蛋白质的共价结构 一、蛋白质通论 当前第1页\共有48页\编于星期五\2点 一、蛋白质的化学组成和分类 蛋白质的元素组成:主要由C、H、O、N、S组成,其中含N平均为16%,这一数据可用于蛋白质的含量测定,是凯氏定氮法测定蛋白质含量的基础。 蛋白质含量=蛋白氮/16%=蛋白氮×6.25 当前第2页\共有48页\编于星期五\2点 蛋白质按化学组成分类 单纯蛋白质:完全由氨基酸组成,不含非蛋白成分。根据溶解性的不同,可将简单蛋白分为7类: 清蛋白(溶于水) 球蛋白(溶于稀盐溶液) 谷蛋白(溶于稀酸或稀碱) 醇溶蛋白(溶于70%-80%的乙醇) 组蛋白(溶于水或稀酸,可用稀氨水沉淀) 精蛋白(溶于水或稀酸,不溶于氨水) 硬蛋白(只能溶于强酸)。 当前第3页\共有48页\编于星期五\2点 (二)缀合蛋白 由蛋白质和非蛋白成分组成,后者称为辅基。根据辅基的不同,可将结合蛋白分为以下7类:核蛋白、脂蛋白、糖蛋白、磷蛋白、血红素蛋白、黄素蛋白和金属蛋白。 当前第4页\共有48页\编于星期五\2点 (三)按蛋白质的生物学功能分类 1.酶 生物体内的酶都是由蛋白质构成的,没有酶,生物体内的各种化学反应就无法正常进行。 2.调节蛋白 某些激素、一切激素受体和许多其他调节因子都是蛋白质 。 3.转运蛋白 脊椎动物的血红蛋白和无脊椎动物的血蓝蛋白起着运输氧气的作用;血液中的载脂蛋白可运输脂肪,转铁蛋白可转运铁;一些脂溶性激素的运输也需要蛋白,如甲状腺素要与甲状腺素结合球蛋白结合才能在血液中运输。 当前第5页\共有48页\编于星期五\2点 4.贮存蛋白 某些蛋白质的作用是贮存氨基酸作为生物体的养料和胚胎或幼儿生长发育的原料。此类蛋白质包括蛋类中的卵清蛋白、奶类中的酪蛋白和小麦种子中的麦醇溶蛋白等。肝脏中的铁蛋白可将血液中多余的铁储存起来,供缺铁时使用。 5.收缩和游动蛋白 肌肉中的肌球蛋白和肌动蛋白是运动系统的必要成分,它们构像的改变引起肌肉的收缩,带动机体运动。细菌中的鞭毛蛋白有类似的作用,它的收缩引起鞭毛的摆动,从而使细菌在水中游动。 6.结构蛋白 蛋白质可以作为生物体的结构成分。高等动物的胶原蛋白是主要的细胞外结构蛋白,占蛋白总量的1/4;细胞膜、线粒体、叶绿体和内质网等膜系统都是由蛋白质与脂类组成的;动物的毛发和指甲都是由角蛋白构成的。 当前第6页\共有48页\编于星期五\2点 7. 支架蛋白 这一类蛋白质主要起到支架作用,并且在这种蛋白上能完成某些蛋白的装配。如锚定蛋白就属于支架蛋白。 8.保护和开发蛋白 高等动物的免疫反应是机体的一种防御机能,它主要也是通过蛋白质(抗体)来实现的。凝血与纤溶系统的蛋白因子、溶菌酶、干扰素等,也担负着防御和保护功能。某些生物能合成有毒的蛋白质,用以攻击或自卫。白喉毒素可抑制真核生物的蛋白质合成。 9.异常蛋白 除具有上述功能蛋白质以外的一类蛋白质。 当前第7页\共有48页\编于星期五\2点 二、蛋白质的形状和大小 按蛋白质的形状和溶解度可将蛋白质分为:纤维状蛋白质、球状蛋白质和膜蛋白质。 蛋白质的相对分子质量差别很大。 当前第8页\共有48页\编于星期五\2点 三、蛋白质构像和蛋白质结构的组织层次 蛋白质的结构复杂,可分为不同的结构层次: 一级结构:
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