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酵母对纤维素乙醇生产中的抑制剂响应的系统生物学研究的中期报告
摘要:
纤维素乙醇生产是一个非常具有潜力的生物能源生产方法,但是由于纤维素降解的抑制剂的存在,其经济性和可行性方面存在挑战。酵母在纤维素乙醇生产中具有很高的生产能力。然而,酵母对抑制剂的响应机制还不完全清楚。因此,本研究旨在通过系统生物学方法来研究酵母对纤维素乙醇生产中的抑制剂响应。
在本研究中,我们使用了酵母Saccharomyces cerevisiae,并考虑到在纤维素水解产生的主要抑制剂中,酸和酚类化合物是最常见的,确定了乙酸和酚类化合物对酵母生长和代谢的影响。初步的实验结果表明,这些抑制剂影响了酵母的细胞生长、糖代谢和酒精代谢。因此,我们进一步使用转录组分析和代谢组分析的方法,研究了酵母在不同浓度下接触乙酸和酚类化合物时的转录组和代谢组水平的变化。
在转录组分析中,我们发现,酵母对乙酸和酚类化合物的反应不同。乙酸对酵母的基因表达产生了相当大的影响,包括了呼吸过程、脂肪酸代谢、细胞曲张应激反应、染色质重构和细胞周期等诸多方面。另一方面,酚类化合物对酵母的基因表达变化相对较小,主要与氧化应激相关的表达谱有一些变化。
在代谢组分析中,我们发现,酵母在乙酸和酚类化合物的存在下,酒精代谢和糖代谢中的多种物质产量明显减少。通过分析不同酒精代谢途径中产物的变化,我们发现乙酸和酚类化合物影响了乙醇代谢和丙酮酸代谢。在糖代谢方面,乙酸和酚类化合物对无氧代谢的抑制显著弱于有氧代谢。
综上,我们的研究建立了乙酸和酚类化合物对纤维素乙醇生产中酵母的影响模型,并通过转录组和代谢组分析,揭示了酵母在不同抑制剂浓度下的响应机制,为今后酵母纤维素乙醇生产优化提供了重要的理论基础。
关键词:酵母、纤维素乙醇、抑制剂响应、系统生物学、转录组、代谢组
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