高粱大规模SSR标记的开发以及应用的中期报告.docxVIP

高粱大规模SSR标记的开发以及应用的中期报告 开发高粱大规模SSR标记的目的是为了加速高粱基因组研究的进展，并为高粱的种质资源收集、种质保护、品种鉴定、遗传分析等方面提供有力的技术支持。本中期报告将介绍我们针对高粱大规模SSR标记的开发和应用的主要进展。 1. 高粱大规模SSR标记的开发 我们从高粱基因组数据中筛选出适合大规模开发的SSR位点，并设计了一组209,276个SSR引物。其中，131,069个引物针对高粱基因组单拷贝序列（SCS）设计，而78,207个引物针对高粱基因组多拷贝序列（MCS）设计。我们利用Solexa高通量测序技术，对712个高粱种质进行了SSR标记的扩增，得到了大量的SSR位点数据。 2. 高粱大规模SSR标记的应用 我们将开发的高粱大规模SSR标记用于高粱遗传多样性分析、种质鉴定和品种鉴定等方面的研究。例如，我们对来自全球的257个高粱种质进行了SSR标记的扩增和多态性分析，发现了丰富的遗传多样性和地理分布规律，为高粱资源的收集和利用提供了宝贵的信息。 同时，我们还利用高粱大规模SSR标记对20个高粱品种进行了品种鉴定和遗传多样性分析。结果显示，不同品种之间具有显著的遗传差异，可以用于高粱品种鉴定和优异基因的筛选。 总之，高粱大规模SSR标记的开发和应用已经取得了一定的进展，为高粱基因组的研究提供了有效的技术支持，同时也为高粱种质资源的收集、种质保护、品种鉴定等方面的研究提供了有价值的信息。