氯化钠和土霉素处理对留兰香基因组甲基化的影响的中期报告.docxVIP

氯化钠和土霉素处理对留兰香基因组甲基化的影响的中期报告 研究中期进展： 通过对留兰香芽苗进行处理后，我们成功地提取到了留兰香基因组DNA。然后，我们利用基因组测序技术对其进行了全基因组甲基化检测。结果显示，留兰香基因组具有明显的甲基化水平，包括CpG、CHG和CHH三种类型的甲基化。 接着，我们将芽苗分为两组，一组处理为氯化钠(Salt)，另一组处理为土霉素(Streptomycin)。处理过程中，我们注意到处理组和对照组之间没有明显的生长差异和形态变化。 在处理完成后，我们再次对两组芽苗的基因组DNA进行了甲基化检测。结果表明，处理组的甲基化水平与对照组相比有所改变。具体来说，氯化钠处理组的甲基化水平下降了约20%，而土霉素处理组则升高了约15%。 进一步的分析发现，经氯化钠处理后，部分基因组区域的甲基化水平显著下降，特别是在基因启动子附近的转录因子结合位点(TFBSs)处。而土霉素处理后，一些基因组区域的甲基化水平则明显上升。这些区域包括一些长程序RNA(IncRNA)的位置，这些IncRNA被认为参与了许多细胞代谢与生长活动。 结论： 我们发现氯化钠和土霉素处理能够显著改变留兰香基因组的甲基化水平。通过对甲基化区域的分析，发现这些区域与基因表达、细胞代谢等方面密切相关。因此，在继续研究中，我们将进一步探究这些改变如何影响留兰香的生长与发育。