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HAb18GCD147胞外区与肽类拮抗剂的分子对接研究的中期报告
本次研究旨在探究HAb18GCD147(一种新型抗肿瘤治疗药物)在其胞外区与不同肽类拮抗剂之间的分子对接方式,以期为该药物的设计及研发提供新的理论基础。
首先,我们采用软件对HAb18GCD147的胞外区进行了结构构建,其中重点关注了该药物分子在活性中心的构象和位置,保证其能够与配体分子正确匹配。
然后,我们选用两种肽类拮抗剂(分别以P1和P2表示),并将其与HAb18GCD147进行分子对接研究。在此过程中,我们使用了分子模拟的方法,结合分子力场、算法和计算机技术,对药物分子和肽类分子进行了基于分子力学和量子力学的模拟。
结果表明,HAb18GCD147与P1和P2的分子对接方式存在明显差异。具体而言,对于P1而言,其可与药物分子进行两种不同的作用方式:一种是通过靠近药物分子的苯环与其相互作用,另一种则是通过氢键形成。而对于P2而言,其则主要通过靠近药物分子的环状结构及其侧链与其产生作用。
综上所述,本研究从分子层面揭示了HAb18GCD147药物分子与肽类拮抗剂之间的分子对接机制和相互作用方式。这为进一步优化该药物的结构设计和功能研究提供了新的思路和方向。
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