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Western-Blot之磷酸化蛋白之路
做磷酸化蛋白,磷酸酶抑制剂必不可少,若没有磷酸酶抑制剂,磷酸化蛋白很容易发生去磷酸化,轻者导致条带不明显,重者没有条带,从而导致实验重复性变差。下图就是加入磷酸酶抑制剂和不加磷酸酶抑制剂的区别(有图有真相,图1)。
图1.加入磷酸酶抑制剂和不加入磷酸酶抑制剂的条带区别
提蛋白一定全程要在4℃环境,尽量不要用超声波细胞破碎仪来粉碎细胞,低温高速离心机的转速不要超过14000rmp,时间不要超过10分钟,以5到8分钟为宜。得到的上清样品立即煮沸(最好用PCR仪煮沸)。所提取的蛋白样品一定要在两到三个星期之内全部做完。
凝胶电泳时,配置凝胶的试剂必须是两周之内新配制的,电泳缓冲液和转膜缓冲液必须现配现用,电泳时间不能超过2个小时。转膜完成后要用TBST缓冲液漂洗PVDF膜。
封闭液和抗体稀释液,最好选用3%或者5%的BSA溶液(具体浓度看抗体说明书)。不可以用牛奶去配制上述液体,因为牛奶里还有酪蛋白,可以促进蛋白质的去磷酸化,使磷酸化蛋白的条带变浅,甚至消失(用图说话,图2)。抗体尽量选用品牌抗体(Abcam,CST),一分钱一分货。
图2.BSA和脱脂奶粉封闭后的条带差别
Western跑磷酸化蛋白的要点
抗体
(1)并不是最贵的就是最好的,如果条件允许,建议同时购买不同厂家的抗体,一起来试一试,因为有时候即使是最好的品牌,不同批次稳定性也不一样。
(2)抗体从订购到到货有一定的时间,所以到货后请尽快分装好,准备做实验,我们当时因为实验进度问题,抗体到了3个多月才开始正式实验,这样拖了时间找厂家售后申诉也是很被动的。
(3)我们那时候用CST的一抗,感觉效果不稳定,也可能跟抗体放久了有关。最后买了另一家代理的抗体算是有了比较稳定的结果。当然,还是选择购买口碑较好的公司的产品为佳,这样即使出了问题售后也会跟进。如果经费有限,可以买买小包装的产品先试试,不少抗体公司还有5ul的抗体试用装免费申请。
(4)孵育一抗的时候,建议用新鲜抗体,什么意思呢?很多同学因为想图省事儿,很多时候配好孵育液,每次孵育好之后再次放进冰箱等待下次重复利用,一些比较好跑的蛋白到时没啥问题,但是磷酸化的蛋白建议每次都用新鲜的抗体原液,将条带剪下来后用杂交袋塑封好,按1:1000的比例加入抗体原液孵育,再这种情况下,100ul的抗体也是能用很久的,所以尽量每次都用新的抗体。
电泳
不同kb的蛋白电泳时间有所差别,参数啥的要用脑子更改,不能一成不变,避免发生那种蛋白跑不见了的惨剧。
洗膜
严格遵守洗膜时间,不得减少次数,每个步骤洗3次,每次可以洗长一点,比如(11-12分钟)。
蛋白上样
普遍反映磷酸化的条带很淡,有时候达不到制图标准,这点可以加大上样量来解决,另外,磷酸化蛋白一般与非磷酸化的蛋白一起跑一起制图,它本来就是要比非磷酸化的要淡一些,不要过分担心。
封闭
这个步骤非常重要,强推BSA封闭,不要用脱脂奶粉封闭,BSA封闭对磷酸化的抗体效果非常好,而且也不贵。另外,BSA封闭液倒是可以反复使用不至于向奶粉一样臭掉,用来孵育一般非磷酸化的抗体,效果同样棒棒哒!
再者,封闭时间可以延长,一般封闭2-3小时的情况下,可以封闭延时到4小时。
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