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各种肽的主链结构都一样共价主链(mainchain或backbone):肽链骨干由-N-Cα-C-序列重复排列而成;N:酰胺氮;Cα:氨基酸残基的α碳;C:羰基碳;各种肽的主链结构都是一样的,但侧链R基的序列(也即氨基酸序列)不同;蛋白质的种类和生物活性都与肽链中的氨基酸顺序有关;第94页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三2.3.2生物活性肽的功能P33自己阅读。第95页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三2.3.3活性肽的来源P35自己阅读。第96页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三2.3.4活性肽的应用P35自己阅读。第97页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三肽链(蛋白质)的酶水解第98页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三肽链(蛋白质)的酶水解举例第99页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三2.4蛋白质的结构P36第100页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三2.4.1蛋白质的一级结构P36指氨基酸如何连接成肽键和氨基酸在肽链中的排列顺序;第101页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三2.4.2蛋白质的空间结构P37研究蛋白质构象的方法——x射线衍射法第102页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三一个特定蛋白质行使其功能的能力
常由它的三维结构或构象决定正常情况下,蛋白质以紧密折叠的结构存在;蛋白质的天然折叠结构决定于3个因素:①与溶剂分子(一般是水)的相互作用;②溶剂的pH和离子组成;③蛋白质的氨基酸序列(最重要因素);蛋白质分子的结构中有多种力处于精细的平衡中,决定蛋白质独特构象;第103页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三肽链中相邻肽键的空间结构3-1P191)肽键键长0.132nm,介于C-N单键(0.147nm)和C=N双键(0.127nm)之间,且更接近于C=N,故肽键具有部分双键性质,不能自由旋转;2)形成肽键的4个原子(C、O、N、H)和与之相连的2个α-碳原子共处在一个平面上,形成酰胺平面;3)在酰胺平面中C=O与N-H呈反式;第104页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三肽链中相邻肽键的空间结构3-2
酰胺平面和两面角示意图4)肽链的主链由许多酰胺平面组成,α-碳原子是两个相邻酰胺平面的连接点;5)α-碳原子连接的两个键Cα-N键和Cα-C键是单键;绕Cα-N键旋转的角度称φ角;绕Cα-C键旋转的角度称ψ角;φ=0°ψ=0°时的主链构象第105页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三肽链中相邻肽键的空间结构
酰胺平面和两面角示意图
3-36)从Cα沿键轴看:顺时针旋转的φ和Ψ角为正值,反之为负值;7)当旋转键两侧的主链处于顺时构型时规定ψ或φ=0°;完全伸展的主链结构第106页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三(1)稳定蛋白质中空间结构的作用力P37蛋白质分子结构的稳定性靠分子中的多种化学键维持;蛋白质分子如受某些理化等因素影响,结构发生改变,其性质和功能都会发生改变;第107页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三蛋白质分子中的化学键1)共价键:如肽键、二硫键(存在于两个半胱氨酸之间)、酯键;2)非共价键(次级键):如氢键、离子键(又称盐键)、疏水键、范德华力等;氢键、离子键和酯键存在于极性基团之间;疏水键、范德华力存在于非极性基团之间;第108页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三稳定蛋白质三维结构的各种作用力图示P38图2-6第109页,讲稿共170页,2023年5月2日,星期三稳定蛋白质三维结构的力肽键是肽链的基本键,其他各种化学键参加链中及链间联系;1)一级结构的肽链是由肽键-CO-NH-连接而成,同一肽链中不同部位有的还有二硫(-S-S-)桥键(如胰岛素),有的含有磷酸酯键或羧酸酯键;2)二级结构的螺旋构象
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