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抗病毒相关药效团的构建及评价方法研究的开题报告

一、课题研究背景和意义

新型冠状病毒（COVID-19）肆虐全球，世界各地都在积极研发抗疫药物，其中药效团的构建与评价方法是一个重要的研究方向。药效团是一组具有相似物理、化学性质并能与生物靶点发生特定相互作用的分子。药效团研究可以为新药的发现和设计提供方向，节约药物研发周期和成本。因此，本课题旨在研究抗病毒相关药效团的构建及其评价方法，为疫情防控和药物研发提供理论和实践支持。

二、研究目标和内容

1.分析目前已有的抗病毒药物及其作用机制，挖掘药效团并进行药效团聚类分析；

2.建立药效团库，并对药效团进行可视化展示，便于药物研发人员查找和使用；

3.研究评价药效团性能的指标与模型，并评价药效团库中的药效团；

4.通过实验验证药效团的可靠性和有效性，为抗病毒药物研发提供理论和实践支持。

三、研究方法

1.文献综述法：对已有的抗病毒药物及药效团相关文献进行综述和分析；

2.数据挖掘法：通过大数据处理方法挖掘药效团，并进行聚类分析；

3.计算机辅助药物设计（CADD）：使用CADD对药效团进行性能评价，建立药效团库；

4.分子实验：通过实验验证药效团的可靠性和有效性。

四、研究预期成果

1.建立抗病毒相关药效团库，并进行可视化展示；

2.确定评价药效团性能的指标和模型；

3.验证药效团的可靠性和有效性；

4.为抗病毒药物研发提供理论和实践支持。

五、进度安排

1.学期一：开题、文献综述和分析；

2.学期二：药效团挖掘和聚类分析、药效团库的建立和可视化展示；

3.学期三：药效团性能评价指标和模型的确定；

4.学期四：实验验证药效团的可靠性和有效性，撰写论文。

六、参考文献

1.Li,Y.,Li,H.Q.,Zhang,Y.Q.,Ma,Y.H.(2017).Reviewofthecomputer-aideddrugdesign(CADD)approachesagainsttheEbolavirus.Drugdesign,developmentandtherapy,11,2405.

2.Zhang,L.,Ai,H.,Chen,W.,Yang,K.,Zhuang,W.,Wu,M.(2017).ThediscoveryofpotentialinhibitorsforEbolavirusanditsassociatedproteases:acomputationalapproach.Scientificreports,7,944.

3.Rizzo,R.C.(2018).Computationalmethodologiesforfragment-baseddrugdiscoveryanddesign.Journalofcomputer-aidedmoleculardesign,32(7),647-671.