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丙酮丁醇梭菌EA2018的全基因组测序及比较基因组学研究的开题报告

一、研究背景

丙酮丁醇梭菌（Clostridiumacetobutylicum）是一种革兰氏阳性菌，是工业化学品丙酮和丁醇的重要发酵生产菌种。此外，丙酮丁醇梭菌还具有生物质转化能力，可以将稻草、玉米秸秆等生物质资源转化为有机物质。因此，丙酮丁醇梭菌在工业发酵和生物质资源利用等领域具有重要应用价值。目前，虽然已经对丙酮丁醇梭菌进行了广泛的基因组研究，但是关于这种菌在代谢调控、胁迫应答等方面的机理研究还有待深入探究。

二、研究目的

本课题拟通过对于丙酮丁醇梭菌EA2018进行全基因组测序和比较基因组学研究，揭示其代谢调控、胁迫应答等方面的机理，为该菌在工业发酵和生物质资源利用等领域的应用提供理论支撑。

三、研究内容与方法

1.丙酮丁醇梭菌EA2018的全基因组测序：使用IlluminaHiSeq2500平台对该菌株全基因组进行测序，并进行基因注释和基因组组装。

2.比较基因组学研究：将丙酮丁醇梭菌EA2018和已经测序完成的丙酮丁醇梭菌菌株的基因组序列进行比较，分析它们之间的差异以及这些差异在代谢调控、胁迫应答等方面的功能。

四、预期成果

1.完成丙酮丁醇梭菌EA2018的全基因组测序和基因组注释，并获得该菌基因组序列。

2.分析丙酮丁醇梭菌EA2018与其他丙酮丁醇梭菌菌株之间的基因组差异，以及这些差异在代谢调控、胁迫应答等方面的功能。

3.发表相关研究论文。

五、研究意义

1.填补丙酮丁醇梭菌EA2018的遗传学空白和序列信息，为该菌在工业发酵和生物质资源利用等领域的应用提供理论支撑。

2.通过比较基因组学研究，揭示丙酮丁醇梭菌EA2018在代谢调控、胁迫应答等方面的机理，为更深入地研究该菌的生物学特性提供参考依据。

3.为相关领域研究人员提供参考，推动相关领域的发展。