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应用ABEEMσπ模型计算蛋白质电荷分布及并行程序实现的任务书
任务背景
计算蛋白质分子的电荷分布是计算生物学中的一个重要问题。蛋白质的电荷分布对于其在水溶液中的溶解度、原位酸碱催化活性、蛋白质间相互作用等具有重要的影响。因此，准确地计算蛋白质电荷分布对于蛋白质结构与功能的研究具有重要的意义。ABEEMσπ模型是用于计算分子电荷分布的一种方法，尤其适用于蛋白质和其他生物大分子。
同时，随着计算机技术的发展，使用并行计算实现分子动力学模拟、蛋白质电荷计算等计算任务已成为越来越普遍的选择。
任务内容
本任务要求完成以下两个子任务：
1.利用ABEEMσπ模型计算给定蛋白质分子的电荷分布。输入数据为蛋白质分子的结构坐标，输出数据为每个原子的电荷分布。
2.实现一个并行程序，可以对若干个输入蛋白质进行电荷分布计算。要求实现的程序能够并行计算多个蛋白质，具有良好的计算效率和可扩展性。
任务需求
1.对于子任务1，需要了解ABEEMσπ模型的原理与实现方式，并使用现有的计算工具或编写自己的程序完成该任务。需要输出结果数据，并进行结果分析与可视化展示。若已有现成的程序可以完成该任务，则需要阐述该程序的实现方式和相应的验证结果。
2.对于子任务2，需要了解并行计算的基础知识与编程方法，并使用相应的并行计算框架实现该任务。需要设计良好的并行算法，使得程序在多个处理器或计算节点上具有高效的执行效率，同时可以在不同的计算环境中运行，并且可以处理较大的输入数据集。
任务提示
1.子任务1中，ABEEMσπ模型的实现需要计算分子的点电荷、偶极矩和极化率等物理量，涉及到多项式的计算和求解线性方程组等基本数值计算。可以查阅相关文献和网上资源，或利用现有的计算库或软件实现该模型。
2.子任务2中，需要选择合适的并行计算框架（如MPI、OpenMP、CUDA等），并设计算法实现任务的并行计算。需要考虑并行算法的可扩展性、负载均衡、数据通信等问题，以保证程序可以在多个计算节点或处理器上有效地运行。
3.在完成任务时，要注意保证程序的正确性、性能和可靠性。需要进行充分的测试和验证，确保程序能够正确地处理各种类型的输入数据，并能够在不同的计算环境下稳定运行。
4.在任务报告中，需要清晰地描述所完成的任务内容、实现方式和相关的技术细节，并附上程序代码和示例输入输出数据。同时，需要对结果进行详细的分析和讨论，包括对结果准确性、计算速度、可扩展性等方面的评价。
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