原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
番茄和马铃薯基因组染色体Ⅺ的比较基因组测序及初步分析的中期报告
目前，我们已经完成了番茄和马铃薯基因组染色体Ⅺ的比较基因组测序，并对测序结果进行了初步分析。在本次中期报告中，我们将分享实验的进展情况和初步结果。
实验方法
为了比较番茄和马铃薯基因组，我们在两个物种中选取了染色体Ⅺ进行比较。使用IlluminaHiSeqXTen平台进行基因组测序，生成150bp双端读取，并对数据进行了质控和去除低质量的reads。接着，我们使用Bowtie2将reads比对到参考基因组（番茄：SL3.0和马铃薯：PGSC_DM_v4.03）中，并用SAMtools软件对比对结果进行格式化。
接着，我们使用MCScanX软件来比较番茄和马铃薯的基因组，并预测它们的同源基因对。我们还使用KOBAS3.0进行同源基因对的功能注释和通路分析。
初步结果
我们得到了番茄和马铃薯基因组的比较结果，并预测了它们的同源基因对。结果显示，染色体Ⅺ中，番茄和马铃薯分别有1742和2535个编码基因。我们通过MCScanX软件预测了它们之间的816对同源基因对。通过KOBAS3.0进行通路分析，我们发现这些同源基因对在许多通路中都参与了重要的生物学过程。
结论
本次实验中，我们利用比较基因组测序的方法对番茄和马铃薯基因组的染色体Ⅺ进行了比较，并预测了它们的同源基因对。我们的初步结果表明，这些同源基因对在许多生物学过程中都发挥着重要的作用。在下一步工作中，我们将深入研究这些同源基因对的功能和进化，以更好地理解番茄和马铃薯的基因组演化历程。
文档评论（0）