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本文描述了一种基于几何等距性的特定于抗原的TCR比对的新颖方法(GIANA)。GIANA是一种能够高效处置数千万个序列的特定于抗原的TCR聚类方法。GIANA实现比所有现有方法更高的灵敏度和精度,并且能够以高准确性检索特定于已知抗原的TCR。超大规模TCR聚类和新颖样本的快速查询也实现了一种新颖的基于参考的组库分类框架。GIANA还能够分析已求解TCR区域的单细胞RNA‑seq数据,并且有可能对照公共领域中TCR组库样本的大型数据库从未知数据中查询TCR,并提供关于共享抗原特异性的新见解。GIA
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117693793A
(43)申请公布日2024.03.12
(21)申请号202280044566.7(74)专利代理机构中国贸促会专利商标事务所
(22)申请日2022.06.
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