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猪流行性腹泻病毒地方株LJB/03株分离鉴定的开题报告
【摘要】
猪流行性腹泻病毒(PorcineEpidemicDiarrheaVirus,PEDV)是一种高传染性、致病性强的病毒,造成了严重的畜牧业损失。本次研究分离鉴定了一株地方株LJB/03株PEDV,并进行了分子特征分析。
通过对临床样本的检测,我们分离到一株PEDV,命名为LJB/03。对该株病毒进行了电镜观察和RT-PCR检测,结果均呈现出PEDV的特征。随后,我们对LJB/03株病毒的S、E、M、N基因进行了PCR扩增,并进行了基因测序和分子进化分析。
结果表明,LJB/03株PEDV的S、E、M、N基因序列分别为1915bp、739bp、686bp和1242bp,与已知PEDV比对的核苷酸同源性分别为93.7%、89.4%、89.2%和93.5%。进化树分析表明,该株PEDV与我国其他地方株、以及韩国等国家/地区的PEDV存在较远的分支关系。
本次研究分离鉴定的LJB/03株PEDV具有一定的地方性代表性,为该地区猪流行性腹泻的防治提供了科学依据和参考。
【关键词】猪流行性腹泻病毒;分离鉴定;PCR扩增;分子特征分析
【Abstract】
PorcineEpidemicDiarrheaVirus(PEDV)isahighlyinfectiousandpathogenicvirusthatcausesseriouslossesinthelivestockindustry.Inthisstudy,alocalstrainLJB/03ofPEDVwasisolatedandidentified,andmolecularcharacteristicswereanalyzed.
APEDVstrainnamedLJB/03wasisolatedfromclinicalsamplesandidentifiedbyelectronmicroscopyandRT-PCR.TheS,E,M,andNgenesofLJB/03wereamplifiedbyPCR,andgenesequencingandmolecularevolutionanalysiswereconducted.
TheresultsshowedthattheS,E,M,andNgenesequencesofLJB/03were1915bp,739bp,686bp,and1242bp,andthenucleotidehomologywithknownPEDVswere93.7%,89.4%,89.2%,and93.5%,respectively.EvolutionarytreeanalysisindicatedthatLJB/03wasdistantlyrelatedtoPEDVsfromotherregionsofChina,aswellasthosefromKoreaandothercountries.
TheLJB/03strainofPEDVidentifiedinthisstudyhascertainlocalrepresentativeness,whichprovidesscientificbasisandreferenceforthepreventionandcontrolofporcineepidemicdiarrheainthisregion.
【Keywords】PorcineEpidemicDiarrheaVirus;Isolationandidentification;PCRamplification;Molecularcharacterizationanalysis.
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