广西地方标准《SSR分子标记鉴定甘蔗品种真伪技术方法》（征求意见稿）编制说明.docxVIP

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一、制定意义及任务来源

1目的意义

甘蔗是我国主要的经济作物之一，建国以来，我国推广了20多个优良甘蔗品种，在生产上起着很大的作用。目前，我国的主要生产甘蔗的地区为广西、云南两省。2018年广西甘蔗种植面积达886.40千公顷。

我国为提高和改善甘蔗的产量和品质，优良新品种新资源不断得到引进，由于甘蔗品种的频繁引进和蔗区间品种的调动等因素，造成部分甘蔗品种混淆、种植资源混乱等不良后果，尤其是一些形态特征十分相似的亲本种质资源的混淆给育种者在亲本选配和杂交中带来极大的不便和种质资源重复使用的浪费。因此，研究鉴定和鉴别甘蔗品种和亲本在甘蔗生产和育种方面具有十分重要的意义。

甘蔗遗传基础复杂，主要性状都属于数量性状是受微效多基因控制，受环境影响很大，连锁群多。作物品种鉴定技术不但要可靠准确，还要简单快速经济。利用传统的鉴定方法对甘蔗性状进行鉴定时，需要增加鉴定的成本与时间，才能鉴定甘蔗品种。SSR标记作为高度多态性、重复性好的共显性标记，也被应用于甘蔗种质资源遗传多样性分析、甘蔗遗传连锁图谱构建。SSR标记技术鉴定甘蔗品种真伪技术从基因组DNA水平上分析甘蔗品种的真实性，解决了因为甘蔗品种间的遗传基础日趋狭窄，用传统鉴定方法难以判别品种的问题。毛细管电泳(capillaryelectrophoresis,CE)也叫高效毛细管电泳（HPCE），与普通电泳相比,具有高灵敏度、高分辨率、高速度、样品少等优点；因此，SSR标记与毛细管凝胶电泳相结合应用于甘蔗品种鉴定可以缩短时间，提高鉴定效率。而目前无利用SSR标记与毛细管凝胶电泳相结合鉴定甘蔗品种真伪的方法标准。

2任务来源

2015年由广西分析测试研究中心提出的《SSR分子标记鉴定甘蔗品种真伪技术方法》的制定计划，2015年广西壮族自治区质量技术监督局在关于下达《2015年第二批广西地方标准制定（修订）项目计划的通知》附件文中批准将其列入2015年第二批广西地方标准制定（修订）项目计划(序号：2015-0285)，由广西分析测试研究中心和广西益谱检测技术有限公司等主要负责起草该地方标准的制定任务。

二、工作概述

1国内外相关研究

目前，国内外报道甘蔗属（Saccharum）属于禾本科（Gramineae）中的Andropogoneae族，主要包括：热带种（S.officinarum）、割手密（S.spontaneum）、大茎野生种（S.robustum）、印度种（S.barber）、中国种（S.sinense）、野生肉质花穗种（S.edule），以及当今普遍种植的甘蔗栽培品种。甘蔗属和其近缘属是高度杂合的异源多倍体和非整倍体植物，在植物分类上非常混杂，它们的亲缘关系如何一直是一个有争议的问题。在20世纪90年代之前，人们主要根据甘蔗属的发源地、属内不同种的形态特征、农艺性状，同功酶分析结果等，结合数理统计方法，推断出甘蔗属内种间的遗传关系。但因为甘蔗属及其近缘属的染色体数目不一致，基因组大，遗传背景复杂，利用上述方法得到研究结果往往不一致。90年代之后，随着分子生物技术的迅速发展，许多分子标记技术被应用于研究甘蔗属及其的遗传关系。这些分子标记包括ITS(5SrRNAinter-geneticspacers)，RAPD（RandomAmplifiedPolymorphismDNA，随机扩增多态性DNA标记），RFLP（RestrictionFragmentLengthPolymorphism，限制性内切酶片段长度多态性），AFLP（AmplifiedFragmentLengthPolymorphism，扩增片段长度多态性），SSR（SimpleSequenceRepeats，简单重复序列）。在这些分子标记技术中，SSR分子标记技术具有高多态性、共显性强、操作性与分析简单等特点。应用SSR分子技术进行PCR扩增产物分析的电泳方法，一般有琼脂糖电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、毛细管电泳等电泳技术。毛细管电泳(CapillaryElectrophoresis,CE)是20世纪80年代后期在全球范围内迅速发展的一种分离分析技术，具有快速、高效、高灵敏度、易定量、重现性好及自动化等优点，目前已广泛地应用于化学和生物技术领域之中，如小分子、小离子、多肽及蛋白质的分离分析研究、药物成分分析、DNA测序、DNA多态性分析。目前，已有科学研究者利用SSR分子标记与毛细管电泳技术应用于甘蔗属的遗传分析报道。Cordeiro等人利用21对SSR引物与毛细管电泳技术结合检测甘蔗属野生材料，发现其中17对引物表现出较高的多态性和甘蔗栽培品种的多态信息含量（polymorphisminformationcontent，PIC）较低