新版DNA超螺旋基因组染色体.pptVIP

SuperhelixofSV40DNA(Vinograd,1965)一、DNA超螺旋（superhelixorsupercoil）新版DNA超螺旋基因组染色体第1页

DNA超螺旋结构LinearDNA.LOpenCircleDNAOCrelexedformSupercoiledcircle(高级结构)CovalentClosedCircleCCC指双螺旋环状分子再度螺旋化即成为超螺旋结构。新版DNA超螺旋基因组染色体第2页

超螺旋形成示意末端固定线型双螺旋额外张力不能释放双螺旋以扭曲方式缓解应力,形成超螺旋新版DNA超螺旋基因组染色体第3页

二、DNA超螺旋方向性松弛（relaxed）状态:DNA在水溶液中,构型偏B型状态。DNA以10.5bp/helix为最稳定构型。正超螺旋:小于10.5bp/helix，则其二级结构处于紧缩状态，由此产生超螺旋为正超螺旋。负超螺旋:大于10.5bp/helix，则其二级结构处于松缠状态，由此产生超螺旋为负超螺旋。由此可见,超螺旋总是要向着抵消初级螺旋改变方向发展；双螺旋DNA松开造成形成负超螺旋；而DNA拧紧,则造成形成正超螺旋；全部超螺旋都比松弛型含有更多自由能。新版DNA超螺旋基因组染色体第4页

拓扑学(topology)是研究几何图形在平面位置关系不变情况下空间结构改变规律数学分支。三、DNA超螺旋拓扑学定义试验证实,细胞内DNA存在拓扑异构现象(topoisome),即在保持DNA一级和二级结构不变情况下,两条单链能够相互缠绕,形成不一样空间构型。新版DNA超螺旋基因组染色体第5页

超螺旋发生规律Vinograd.J(1968)VinogradequationL=T+W~(α=β+γ)LLinkingnumber(双链DNA交叉数)TTwistingnumber(双链DNA缠绕数,初级螺旋圈数,即DNA分子中Watson-Crick螺旋周数,其数值可直接在处于最稳定状态下双链环形（或超螺旋形式）DNA中实际螺旋周数计数得到,不一定是整数)WWrithingnumber(直观上为双螺旋数,可为小数)W=负值（negativesuperhelix）W=正值(positivesuperhelix）Non-breakingNon-unwindingNon-overwindingL为定值,整数新版DNA超螺旋基因组染色体第6页

lB-DNA是力学上稳定结构（10bp/helix）l?虽交叉数降低,但需转换为一个应力,以维持10bp/helix螺旋数,l?应力重新分配或在B-DNA状态中保留一单链区或螺旋力将维持B-DNA右旋结构,形成超螺旋420bpL=42T=42W=0无应力松弛状态应力分配L=36T=36W=0L=36T=42W=-6链松弛后再结成环链未松弛再结成环松开6圈螺旋△L=－6新版DNA超螺旋基因组染色体第7页

2.比连系差（Specificlinkingdifference）σσ=△LkLk0=Lk-Lk0Lk0能够依据DNA分子Lk改变描述螺旋不足（超螺旋）,也叫超螺旋密度（superhelixdensity）。新版DNA超螺旋基因组染色体第8页

DNA分子形成超螺旋生物学意义:1．?超螺旋DNA含有更紧密地形状，所以在DNA组装中含有主要作用；2．?DNA结构含有动态性，DNA超螺旋程度改变介导了这种结构改变，这有利于其功效发挥。3．?DNA是一个热力学上稳定结构，超螺旋引入提升了他能量水平。新版DNA超螺旋基因组染色体第9页

拓扑异构体(topoisomer):含有不一样连接数同一个DNA分子称为DNA拓扑异构体。四、DNA拓扑异构体与拓扑异构酶拓扑异构酶(topoisomerase)作用方式:拓扑异构酶与DNA共价结合形成中间体，使磷酸二酯链暂时断裂形成切口，DNA分子一条单链或双螺旋穿越另一条单链或双螺旋，改变其拓扑状态，但一级和二级结构并无改变。即在保持DNA一级和二级结构不变情况下,两条单链能够相互缠绕,形成不一样空间构型。拓扑异构酶(topoisomerase)细胞内存在着一类能催化DNA拓扑异构体相互转化酶,称为拓扑异构酶。或者说,能改变DNA拓扑联络数酶就叫拓扑异构酶。新版DNA超螺旋基因组染色体第10页

Ⅱ型酶在两条单链上都产生切口,每次作用使连接数改变2。在Ⅱ型酶作