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最新由CircAXIN1编码的新蛋白AXIN1-295aa激活Wnt/β-catenin
信号通路促进胃癌进展
环状RNA(circRNAs)是一类具有共价闭环结构的转录本。它们没有
5‘到3’的极性或Polya尾巴。大多数CircRNA是由外显子的后向剪接
产生的,这是一种非规范的剪接过程。CircRNA以组织特异性、发育阶段
特异性和疾病特异性的方式表达。它们被认为是微RNA海绵、转录调节
剂和介导蛋白质相互作用或定位的支架。
由于缺乏有效的早期诊断工具,胃癌在中国和世界范围内死亡率很
高。CircRNA的高度稳定性使其成为早期诊断的分子生物标志物。Wnt/
β-catenin信号通路在正常胚胎发育、组织分化、动态平衡和肿瘤发生中
起重要作用。在大多数癌症中观察到Wnt信号的突变,因为它是细胞存
活所必需的。
虽然环状RNA在几十年前就被发现了,但直到最近平行测序的进展
和应用,它才被忽视。此后的研究表明,CircRNA是保守的、丰富的,在
真核细胞中广泛存在,在那里它们起着重要的调节作用。除了作为micro
rna海绵和与蛋白质复合物相互作用外,CircRNAs还被发现具有编码潜
力。植物初级基因miR171b和miR165a翻译的调节肽可以延缓根的发育。
在本研究中,作者发现CircAXIN1编码新的蛋白AXIN1-295aa,促进胃
癌的进展。
在筛选具有编码潜能的功能性CircRNA时,必须考虑几个标准。首
先,CircRNA在GC中的差异表达水平相对较高,这使得它很容易被检测
到。其次,CircRNA必须包含一个完整的ORF,并且这个ORF应该跨越
连接位点。第三,父母的基因与癌症的发生有关。越来越多的数据表明,
CircRNA的功能与其亲本基因高度相关。第四,被预测编码蛋白质的Cir
cRNA并不一定表达该蛋白质。必须使用实验工具来验证CircRNA的实际
蛋白质表达。
在寻找潜在的编码CircRNA的过程中,作者只考虑了跨越连接的O
RF,因为只有它们才能与那些从其线性对应物编码的肽区分开来。然而,
也可能从CircRNA翻译出跨越连接的ORF以外的多肽。作者也使用核糖
体测序来寻找编码的Circrna;然而,作者发现CircAXIN1的连接位点没有
与核糖体结合,这可能是由于核糖体轮廓测序中核糖体保护的特定连接位
点的条件过于严格所致。
这些新蛋白的功能在很大程度上仍不清楚。大多数由CircRNA翻译
而来的蛋白质与它们的亲本基因编码的蛋白质共享其N端,从而为亲本蛋
白产生诱饵或竞争对手。作者推测,从早期的长期炎症、肠上皮化生、原
位癌到远处转移,CircRNA的翻译可能在癌症的发展过程中得到增强。这
一假说值得进一步研究。
通过直接结合所有其他核心成分,即β-catenin、Apc、CKα和Gsk
3β,AXIN1充当Wnt途径破坏复合物的中心支架。作者认为AXIN1295
aa与β-catenin和Gsk3β是通过与ApC结合而间接结合的。本研究假设
AXIN1-295aa饱和了可用的APC,使得AXIN1、CKα和GSK3β不能形
成正常的破坏复合体。β-catenin随后移位到细胞核并激活下游基因。
CircRNA的高度稳定性使其成为一个很好的候选生物标记物。此外,
作者还发现CircAXIN1在胃癌组织中的表达明显高于正常组织,并且与肿
瘤浸润深度、分化程度、肿瘤分期和淋巴结转移有关,提示CircAXIN1有
可能作为胃癌预后的生物标志物。
这项研究首次确定CircAXIN1是可翻译的,并促进胃癌的发生和侵
袭性。作者发现CircAXIN1在胃癌中高表达,并与淋巴结转移有关。作者
发现CircAXIN1编码功能肽AXIN1-295aa,它竞争性地与APC结合,导
致β-catenin的释放和核转位。最终,β-catenin反式激活规范的Wnt途
径,诱导Wnt依赖的基因表达,促进细胞增殖和迁移。
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