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ICS65.020.30B44
DB14
山西省地方标准
DB14/T1942—2019
实验动物中国地鼠微卫星DNA检测方法
LaboratoryanimalMethodformicrosatellitemarkersofChinesehamster
2019-12-01发布2020-02-01实施
山西省市场监督管理局发布
DB14/T1942—2019
I
目次
前言 II
1范围 1
2术语和定义 1
3抽样 1
4方法 2
DB14/T1942—2019
II
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则编写。
本标准由山西省科学技术厅提出、归口并监督实施。本标准起草单位:山西医科大学。
本标准主要起草人:宋国华、刘田福、陈朝阳、高继萍、张锐虎、续国强。
DB14/T1942—2019
1
实验动物中国地鼠微卫星DNA检测方法
1范围
本标准规定了实验动物中国地鼠(以下简称实验中国地鼠)遗传检测抽样数量及微卫星DNA检测方法。
本标准适用于实验中国地鼠品系鉴别、质量控制及遗传组成分析。
2术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
2.1
实验中国地鼠laboratoryChinesehamster
指经人工饲育,对其携带的微生物和寄生虫实行控制,遗传背景明确或者来源清楚,用于科学研究、
教学、生产和检定以及其它科学实验的中国地鼠(Gricetulusgriseus)。
2.2
近交系中国地鼠inbredstrainChinesehamster
以全同胞或亲子交配方式繁殖20代以上的中国地鼠,近交系数达98.6%以上。
2.3
封闭群中国地鼠closedcolonyChinesehamster
以非近亲交配方式繁殖中国地鼠,在不从外部引入新个体的条件下,至少连续繁殖4代以上。
2.4
微卫星DNAmicrosatelliteDNA
是指基因组中由1~6个碱基组成的串联重复序列。不同个体的重复数不同而形成了微卫星DNA的多态性。
3抽样
对近交系中国地鼠抽样数量不做要求。每个封闭群随机抽取非同窝成年实验中国地鼠,雌雄各半。采样数量按表1进行。
DB14/T1942—2019
2
表1封闭群实验中国地鼠遗传检测抽样要求
群体数量(只)
抽样数量(只)
少于100
≥15
大于100
≥30
4方法
4.1采样
观察动物外观,核对编号,中国地鼠取0.5cm尾尖组织或眼眶静脉丛采血,-20℃低温保存。
4.2微卫星位点的选择
各微卫星位点的名称、引物序列、等位基因数、PCR反应的退火温度见表2。PCR引物的5’端用
FAM荧光染料进行标记。近交系中国地鼠在表2中选择10个微卫星位点,封闭群中国地鼠在表2中选择15个微卫星位点。
表2中国地鼠微卫星位点
位点
引物序列
退火温度(°C)
片段大小
最大等位基因数
Chm35
F:AGGCTGCTTCCTAAACCCAT
51
354-391
4
R:CTGGGAAGGCTGAACTCAAG
Chm93
F:TCTGTGTGTCTGTGAATGCG
58
242-299
7
R:GGATGTAAGATGGCTCCGAA
Chm147
F:CATCTGGGCTTTCAATGGAT
58
233-292
9
R:GCTCCCTAAATAACCCCCAA
Chm79
F:AGGGGAGATCTTGGGTCAGT
51
270-355
5
R:AACATGGAGGAGCACAAACC
Chm120
F:GATAGGAGGGAGCAAAAGGG
58
376-432
12
R:CCTGAGAGCCTCAGAGCAGT
Chm162
F:TCTTCCCTTCACAACCCAAG
58
167-214
12
R:AGCAGTGCCCTTTGAAACAT
Chm10
F:GGCTGGTGATTTCAATGGTT
59
217-357
5
DB14/T1942—2019
3
R:GTTCTTAATGGATCTACCCTGGGACC
Chm108
F:CAATGGCTGCTAAGAGAGGG
59
392-471
5
R:GTTCTTTCCCACTCACAATTTTCCTTG
Chm115
F:TACTCCTGTCTCCACCTCCC
59
17
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