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ActaEntomologicaSinica,May2011,54(5)548-554ISSN0454-6296
斑翅草螽线粒体基因组序列测定与分析
1,323,＊14
周志军,尚娜,黄原,石福明,韦仕珍
(1.河北大学生命科学学院,河北保定071002;2.河北大学图书馆,河北保定071002;
3.陕西师范大学生命科学学院,西安710062;4.河池学院化生系,广西宜州546300)
摘要:已经测定的昆虫线粒体基因组中,直翅目草螽亚科的疑钩额螽Ruspoliadubia线粒体控制区长度最短,仅70
bp。为此,本研究采用L-PCR结合二次PCR扩增策略对另一种草螽亚科昆虫斑翅草螽Conocephalusmaculates线粒体
基因组序列进行了测定。序列注释发现:斑翅草螽线粒体基因组序列全长15898bp,A+T含量为72.05%,基因排
列与典型的节肢动物线粒体基因组一致。全部蛋白质编码基因以典型的ATN作为起始密码子,9个蛋白质编码基因
具有完整的终止密码子,其余4个以不完整的T作为终止信号。除trnSAGN外,其余21个tRNAs均可折叠形成典型的
三叶草结构,依照Steinberg等(1997)线粒体特殊tRNA结构类型-9,trnSAGN的DHU臂形成一个7nt环,反密码子臂
则长达9bp,含1个突起碱基,而不是正常的5bp。斑翅草螽与其他直翅目昆虫线粒体基因组的主要区别在于,在
trnSUCN和nad1,nad1和trnLCUN基因间各存在一段罕见的、大段的基因间隔序列,长度分别为78bp和360bp。其中,
位于nad1和trnLCUN之间的基因间隔序列N链可形成一个包含完整起始、终止密码子(ATT/TAA)、编码103个氨基酸
的未知开放阅读框。同义密码子使用偏好与线粒体基因组编码的tRNA反密码子匹配情况无关,但与密码子第3位
点的碱基组成紧密相关;相对密码子使用频率(relativesynonymouscodonusage,RSCU)大于1的密码子,其第3位点
全部是A或T。在已经测定的直翅目昆虫线粒体基因组tRNAs中,均存在一定数量的碱基错配,且以G-U弱配对为
主,表明G-U配对在线粒体基因组中可能是一种正常的碱基配对形式。本研究测定的斑翅草螽线粒体基因组序列,
和先前已经测定的直翅目线粒体基因组序列一起,可以为重建直翅目的进化历史提供数据资源。
关键词:斑翅草螽;线粒体基因组;序列分析;基因间隔序列;相对密码子使用频率
中图分类号:Q966文献标识码:A文章编号:0454-6296(2011)05-0548-07
SequencingandanalysisofthemitochondrialgenomeofConocephalus
maculatus(Orthoptera:Conocephalinae)
1,323,＊14
ZHOUZhi-Jun,SHANGNa,HUANGYuan,SHIFu-Ming,WEIShi-Zhen(1.CollegeofLife
Science,HebeiUniversit
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