布鲁氏菌疫苗株S2全基因组测序及牛羊布鲁氏菌比较基因组学研究.pdfVIP

布鲁氏菌疫苗株S2全基因组测序及牛羊布鲁氏菌比较基因组

学研究

红梅;冯陈晨;岳建伟;呼和巴特尔;王文龙

【摘要】目的为了了解布鲁氏菌S2疫苗株全基因组结构及分子生物学功能.方法

对布鲁氏菌疫苗株S2进行全基因组测序,并与GenBank公布的6株牛羊布鲁氏菌

进行比较基因组学研究.结果与结论通过全基因组测序发现S2基因组大小为3

331982bp,预测基因有3243个,GC含量为57.23％.S2预测基因中大多数基因

功能主要与糖代谢、氨基酸代谢、氨基酸转运和膜转运有关.通过比较基因组学研

究发现S2有20个特有基因.另外S2与GenBank公布的S2序列进行比对发现有

19个差异基因.

【期刊名称】《中国人兽共患病学报》

【年(卷),期】2014(030)011

【总页数】4页(P1133-1136)

【关键词】布鲁氏菌;布鲁氏菌疫S2疫苗株;全基因组测序;比较基因组学研究

【作者】红梅;冯陈晨;岳建伟;呼和巴特尔;王文龙

【作者单位】内蒙古农业大学兽医学院,农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室,

呼和浩特010018;内蒙古农业大学兽医学院,农业部动物疾病临床诊疗技术重点实

验室,呼和浩特010018;内蒙古农业大学兽医学院,农业部动物疾病临床诊疗技术重

点实验室,呼和浩特010018;内蒙古农业大学兽医学院,农业部动物疾病临床诊疗技

术重点实验室,呼和浩特010018;内蒙古农业大学兽医学院,农业部动物疾病临床诊

疗技术重点实验室,呼和浩特010018

【正文语种】中文

【中图分类】R378

布鲁氏菌病(Brucellosis，简称布病)是由布鲁氏杆菌(Brucella，简称布氏菌)引起

的一种人兽共患病。布鲁氏杆菌分为7个种。据统计，截至2009年，我国有29

个省(区﹑市)发生人蓄间布鲁氏杆菌病流行，牛﹑羊﹑猪感染达百万头之多。

2009年人感染布鲁氏杆菌病新增病例为3.7万，达到了历史最高水平[1]。国外也

有类似情况，并造成危害[2-3]。

接种疫苗[4]是布鲁氏菌重要的防控手段之一，目前很多国家使用S19和Rev.1疫

苗，而中国广泛使用S2疫苗[5]。S2疫苗是1952年中国兽药监察所从一头进口

猪流产物中分离得到的弱毒活疫苗，此疫苗在上世纪60～70年代为中国布鲁氏菌

病防控做出了巨大贡献。目前S2疫苗口服接种比较多，此接种方法安全可靠，操

作简便。此外，该疫苗适用的宿主广泛，毒力弱，免疫效果优良[5]，为此在广大

农牧区得到广泛应用。

本实验通过布鲁氏菌S2疫苗株全基因组测序，并与牛羊布鲁氏菌进行比较基因组

学研究，了解S2疫苗全基因组结构及分子生物学功能，为布鲁氏菌病诊断方法奠

定基础。

1材料与方法

1.1菌株S2疫苗株(金宇保灵生物药品有限公司)

1.2主要试剂AxygenDNA提取试剂盒,琼脂糖，核酸染料，λ-HindⅢdigest

DNAmarker(Takara公司)，DL2000(Takara公司)

1.3DNA提取及凝胶电泳检测按AxygenDNA提取试剂盒说明书提取DNA，取

2μL提取的基因组DNA用1%琼脂糖凝胶电泳进行检测。

1.4S2全基因组测序布鲁氏菌S2基因组DNA样品委托深圳华大基因科技有限公

司进行全基因组序列测定、基因预测、基因功能注释、非编码RNA预测、前噬菌

体预测、基因岛预测工作。

1.5S2与牛羊布鲁氏菌进行比较基因组学研究S2与牛布鲁氏菌S19、2308、9-

941及羊布鲁氏菌M5-90、M28、NI进行比较基因组学研究，找出S2疫苗株特

有基因。

1.6S2与GenBank公布的S2序列进行比对S2与GenBank公布的S2序列进行

BLAST比对,找出差异基因。

2结果与分析

2.1DNA提取及检测取2μL提取的基因组DNA样品用1%琼脂糖进行检测，电

泳结果见图1。经分光光度法检测，布鲁氏菌基因组DNA