鸡传染性法氏囊病病毒VP2蛋白配体结合表位的鉴定的开题报告.pdf

鸡传染性法氏囊病病毒VP2蛋白配体结合表位的鉴

定的开题报告

一、研究背景

鸡传染性法氏囊病(CDV)是由法氏囊病病毒(IBDV)引起的一种常见的

急性传染病，多发生于3-6周龄的肉鸡和蛋鸡。IBDV属于Birnaviridae

家族，病毒颗粒包含两个单链RNA、VP1和VP2两个壳蛋白。VP2是病

毒唯一的表位性蛋白，与宿主细胞进行结合，进而引起感染。因此，研

究VP2蛋白的配体结合表位对于研究IBDV的感染机制具有重要意义。

二、研究目的

本研究旨在通过生物信息学方法预测CDVVP2蛋白结构及其表位，

并构建VP2蛋白与其配体结合的三维模型，进一步探究CDV感染的分子

机制，为防治CDV提供新思路。

三、研究内容及方案

1.预测CDVVP2蛋白的结构和表位：

利用基于序列的方法和结构预测软件对CDVVP2蛋白的二级结构、

三级结构和表位进行预测，并通过功能域分析和进化保守性评估，筛选

出重要的结构域和表位。

2.构建CDVVP2蛋白与其配体的三维模型：

根据预测的结构和表位，利用蛋白质分子对接软件构建CDVVP2蛋

白与其配体的三维模型，并进行能量最小化优化。

3.验证CDVVP2蛋白的配体结合表位：

利用同步辐射小角散射(SAXS)技术进行CDVVP2蛋白与其配体的结

合情况检测。同时，通过基于动力学模拟的微细分子模拟技术进行验证

和优化，得到最终可靠的CDVVP2蛋白与其配体的结合模型。

四、预期成果

1.预测和解析CDVVP2蛋白的结构和表位，明确其与配体结合的分

子机制。

2.构建CDVVP2蛋白与其配体的三维模型，揭示其结构与功能的关

系。

3.验证CPVVP2蛋白的配体结合表位，为进一步研究CDV感染机制

提供可靠的理论依据。