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海洋微生物生态与应用研究

目录

一、文档概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1海洋微生物概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.1海洋微生物的定义与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.2海洋微生物的多样性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.1.3海洋微生物的生态功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

1.2海洋微生物生态学研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2.1传统研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.2.2现代研究技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.2.3主要研究成果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

1.3海洋微生物应用研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

1.3.1生物技术应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

1.3.2药物开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

1.3.3环境修复．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

1.4本研究的意义与目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

二、海洋微生物生态环境．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.1海洋环境特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.1.1物理环境．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.1.2化学环境．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.1.3生物环境．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.2主要海洋微生物类群．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.3海洋微生物生态位分化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.4海洋微生物群落结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.4.1群落组成．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.4.2群落丰度．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.4.3群落多样性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

三、海洋微生物生态学研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

3.1样品采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

3.1.1样品采集策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

3.1.2样品保存与运输．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

3.1.3样品预处理方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

3.2宏基因组学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

3.2.1宏基因组测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

3.2.2数据分析流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

3.2.3功能基因挖掘．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

3.3稳定同位素标记技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.3.1稳定同位素原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57

3.3.2实验设计与操作．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．