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分子植物育种,2023年,第21卷,第20期,第6625-6637页
MolecularPlant)No.20,6625-6637
研究报告
ResearchReport
水稻CNGCs家族的鉴定及非生物胁迫诱导表达模式分析
周棋胡琴杜雪竹巫燕飞盛锋*
湖北大学生命科学学院,省部共建生物催化与酶工程国家重点实验室,武汉,430062
*通信作者,shengfsk@163.com
摘要为了解水稻CNGCs家族成员的基因结构、进化特征、亚细胞定位、启动子顺式作用元件和生物
学功能,本研究利用生物信息学的手段对水稻CNGCs家族进行鉴定,运用RT-qPCR的方法分析OsCNGCs
在非生物胁迫下的诱导表达模式。结果表明,水稻共有16个CNGCs,分布在1、2、3、4、5、6、9和12号染色
体上。进化树分析显示OsCNGCs可分为4个大组(I,Ⅱ,Ⅲ和IV),而IV组可以细分为IV-A和IV-B2个亚
组。OsCNGCs启动子区域存在多种顺式调控元件,包括各种类型的光响应元件、厌氧诱导响应元件、逆境相
关转录因子结合元件、防御和逆境响应元件、低温响应元件以及各种植物激素响应元件等,暗示OsC-
NGCs在响应多种激素和非生物胁迫中可能存在重要调控作用。多种非生物胁迫诱导表达分析表明,大多
数OsCNGCs基因表现出明显的差异表达。本研究为解析CNGCs家族基因在水稻应对非生物胁迫中的功
能提供了参考。
关键词水稻;环核苷酸门控离子通道;生物信息学;非生物胁迫;表达模式分析
IdentificationofCNGCsGeneFamilyinRiceandItsExpressionPattern
AnalysisInducedbyAbioticStresses
ZhouQiHuQinDuXuezhuWuYanfeiShengFeng
TheStateKeyLaboratoryofBiocatalysisandEnzymeEngineering,CollegeofLifeScience,HubeiUniversity,Wuhan,430062
*
*Correspondingauthor,shengfsk@163.com
DOI:10.13271/j.mpb.021.006625
AbstractTounderstandthegenestructure,evolutionarycharacteristics,subcellularlocation,promotercis-acting
elementsandbiologicalfunctionbioinformaticsanalysiswereconductedtoidentifyriceCNGCsfamily,andthe
inducedexpressionpatternofOsCNGCsunderabioticstresswereanalyzedbyRT-qPCR.Atotalof16fulllength
riceCNGCgeneswereidentifiedanddistributedonchromosomes1,2,3,4,5,6,9and12,whichareclassifiedin-
tofourmajorclasses(I,II,IIandIV)andtwosub-groups(IV-AandIV-B).TheOsCNGCspromotercontaina
varietyofcis-actingregulatoryelementsincludinglight-responsiveelements,anaerobicinducibleresponseele-
ments,stress-relatedtranscriptionfactorbindingelements,defenseandstressresponsiveelements,lowtempera-
tureresponsiveelements,andvariousplanthormoneresponsiveelements,implyingtheirpotentialrolesinre-
sponsetovarioushormonesandstress
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