黄瓜AP2_ERF基因家族全基因组鉴定及表达模式分析.pdfVIP

云南农业大学学报（自然科学），2024，39(3)：127−143

Journal

of

Yunnan

Agricultural

University

(Natural

Science)E-mail:

ynauzkxb@

引文格式：杨巍,

赵丽芬,

杨娟,

等.

黄瓜AP2/ERF基因家族全基因组鉴定及表达模式分析[J].

云南农业大学学报(自然科

学),

2024,

39(3):

127−143.

DOI:

10.12101/j.issn.1004-390X(n).202307016

黄瓜AP2/ERF基因家族全基因组

鉴定及表达模式分析*

1,21,2,341,21,21,2

**

杨巍，

赵丽芬，

杨娟，

李飞，

王天文，

邓英

(1.

贵州省农业科学院

园艺研究所，贵州

贵阳

550000；2.

贵州省园艺工程技术研究中心，贵州

贵阳

550000；

3.

贵州大学

农学院，贵州

贵阳

550025；4.

安顺学院

农学院，贵州

安顺

561000)

摘要:【目的】在黄瓜全基因组中鉴定APETALA2/ethylene

responsive

factor

(AP2/ERF)基因家族，分析其基因

结构与功能及表达模式，为该家族基因在黄瓜生长发育及抵御逆境胁迫中的作用提供参考。【方法】利用生

物信息学对CsaAP2/ERF家族进行鉴定，并分析该家族成员的理化性质、结构与功能、蛋白互作关系、进化关

系和表达模式。【结果】黄瓜全基因组中鉴定出148个AP2/ERF家族成员，根据同源性分为

5个亚族：AP2、

ERF、DREB、RAV和Soloist，各亚族成员的基因结构与保守基序相似。CsaAP2-11和CsaAP2-15是蛋白

互作网络的核心蛋白，与多个蛋白质存在互作关系。共线性分析显示：CsaAP2/ERF与南瓜同源基因进化关系

最为相近。在逆境胁迫(冷、热、盐)下，CsaAP2-15、CsaAP2-18、CsaERF-31、CsaERF-54、CsaERF-64、

CsaERF-65、CsaDERB-37、CsaDREB-38、CsaDREB-45等基因的表达量发生显著变化。【结论】本研究对黄

瓜AP2/ERF家族成员进行系统鉴定和特征分析，并分析了其在多种胁迫下的表达模式，为该家族基因的生物

学功能研究与培育抗逆黄瓜新品种提供了理论基础。

关键词:黄瓜；AP2/ERF转录因子；生物信息学；表达模式

中图分类号:S642.201

文献标志码:A

文章编号:1004–390X

(2024)

03−0127−17

Genome-wideIdentificationandExpressionAnalysisofthe

AP2/ERFGeneFamilyinCucumissativusL.

1,21,2,341,21,21,2

YANG

Wei，ZHAO

Lifen，YANG

Juan，LI

Fei，WANG

Tianwen，DENG

Ying

(1.

Institute

of

Horticulture,