基于属性索引与距离下界分析字符串匹配优化方法.pdfVIP

我们可以对三个属性进行索引：

1.指定前缀位置。

2.该位置的编号。

3.后缀=在整个字符串中给定位置右侧的位置数的

长度。

Supposewearegivenprobestrings,andwe

findstringtbecauseitsjthpositionmatches

theithpositionofs.

AlowerboundoneditdistanceEis:

1.i+j–2plus

2.Theabsolutedifferenceofthelengthsofthe

suffixesofsandt(whatfollowspositionsiandj,

respectively).

假设我们给定探测字符串s，并且我们找到字符

串t，因为它的thth

j位置与s的i位置匹配。

编辑距离E的下界为：

1.i+j–2加

2.s和t的后缀长度的绝对差（分别位于位置i

和j）。

Supposewearegivenprobestrings,and

wefindstringtfirstbecauseitsjthposition

matchestheithpositionofs.

Ifthesuffixesofsandthavelengthskand

m,respectively,thenanupperboundon

thelengthCoftheLCSis1+min(k,m).

假设我们给定探测字符串s，并且我们首先找到

thth

字符串t，因为它的j位置与s的i位置匹配。

如果s和t的后缀分别具有长度k和m，

则LCS的长度C的上限是1+min(k,m)。

IfJisthelimitonJaccarddistance,thenthe

requirementthatE/(E+C)Jbecomes:

i+j–2+|k–m|J(i+j–2+|k–m|+1+min(k,m))

Thus:j+|k–m|(J(i–1+min(k,m))–i+2)/(1–J)

如果J是杰卡德距离的极限，则E/(E+C)

J的要求变为：

i+j–2+|k–m|J(i+j–2+|k–m|+1+min(k,m))

因此：j+|k–m|(J(i–1+min(k,m))–i+2)/(1–J)

Createa3Ͳattributeindexon(symbol,position,

suffixͲlength).

th

Ifstringshassymbolaastheipositionofits

prefix,andthelengthofthesuffixrelativeto

thatpositionisk,addstothebucket(a,i,k).

在（符号、位置、后缀Ͳ长度）上创建3Ͳ属性索引。

th

如果字符串s以符号a作为其前缀的第i个位置，并

且后缀相对于该位置的长度为k，则将s添加到桶(a,

i,k)中。

Considerst