海南普通野生稻遗传多样性分析及核心种质构建.pdfVIP

植物遗传资源学报2024，25（10）：1624-1636

JournalofPlantGeneticResourcesDOI：10.13430/ki.jpgr.20240408001

海南普通野生稻遗传多样性分析及核心种质构建

11，21111，2

翟李楠，唐清杰，周帮纪，周世圳，王惠艰，云勇，

111，21，2

韩义胜，王晴瑜，严小微，邢福能

12

（海南省农业科学院粮食作物研究所/海南省农作物遗传育种重点实验室，海口571100；海南省农业科学院三亚研究院，三亚572025）

摘要：为摸清海南省众多普通野生稻材料之间的亲缘关系，发掘具有代表性的样本，本研究利用32个SSR标记，对来自

海南省11个不同市县的2038份海南普通野生稻资源进行遗传多样性分析及核心种质构建。结果显示，平均有效等位基因

（Ne，Numberofeffectivealleles）为2.479，丰富度Shannon指数（I，Shannonentropyindex）为0.975，Nei′s基因多样性（h，

Nei′sgeneticdiversity）为0.570，多态性位点百分比为96.27%，表明海南普通野生稻的遗传多样性十分丰富。不同地方来源

的海南普通野生稻遗传多样性存在差异，来自临高的海南普通野生稻丰富度最高，琼海的普通野生稻遗传丰富度最低，其

变异主要集中在群体内部。群体结构分析显示当K=2时，DeltaK值最高，将2038份海南普通野生稻资源分成2个类群，第Ⅰ

类群有1145份资源，分别来源于海口、澄迈、儋州、三亚、万宁、琼海、临高、陵水、乐东、东方，第Ⅱ类群有893份资源，分别来

源于海口、文昌和澄迈。利用居群优先及多次聚类的方法构建海南普通野生稻核心种质192份，占总资源（2038份）的

9.42%，核心种质的Shannon指数（I）保留了102.46%，Nei′s基因多样性（h）保留了104.39%，有效降低了原始种质的遗传冗

余度和遗传差异上的重复。海南普通野生稻核心种质代表了原种质的遗传多样性和特异性，为海南普通野生稻资源的有

效利用提供材料。

关键词：海南普通野生稻；SSR标记；遗传多样性；核心种质

GeneticDiversityAnalysisandCoreGermplasmConstruction

ofOryzarufipogonGriff.inHainan

11，21111，2

ZHAILinan，TANGQingjie，ZHOUBangji，ZHOUShizhen，WANGHuijian，YUNYong，

111，21，2

HANYisheng，WANGQingyu，YANXiaowei，XINGFuneng

1

（CerealCropsInstitute，HainanAcademyofAgricultur