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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种工具常用于高通量测序数据的质量控制?
A.BLAST
B.FastQC
C.GATK
D.Salmon
答案:B
解析:FastQC是专门用于评估测序数据质量的工具,可生成包含序列长度、GC含量、质量分数等指标的报告;BLAST用于序列相似性搜索,GATK用于变异检测,Salmon用于转录本定量,均不涉及质量控制核心功能。
人类基因组中,外显子占比约为?
A.1%
B.10%
C.50%
D.80%
答案:A
解析:人类基因组中外显子仅占约1%,大部分为非编码区(如内含子、调控元件等);10%为基因区域(含外显子和内含子),50%和80%为干扰项。
以下哪种数据格式用于存储比对后的测序数据?
A.FASTA
B.FASTQ
C.BAM
D.VCF
答案:C
解析:BAM(BinaryAlignment/Map)是SAM的二进制压缩格式,专门存储测序reads与参考基因组的比对信息;FASTA/FASTQ存储原始序列,VCF存储变异信息。
单核苷酸多态性(SNP)是指?
A.长度1-100bp的插入缺失
B.单个碱基的变异(A/T/C/G替换)
C.染色体数目异常
D.基因拷贝数变化
答案:B
解析:SNP定义为单碱基的替换(如A→G);插入缺失(InDel)是1-100bp的序列增减,染色体数目异常属于核型变异,拷贝数变化(CNV)是基因片段的重复/缺失。
转录组测序(RNA-seq)中,“strandedlibrary”的主要作用是?
A.提高测序读长
B.保留转录本的链特异性信息
C.减少测序错误率
D.增加测序数据量
答案:B
解析:链特异性文库(strandedlibrary)通过标记dUTP等方法保留转录本的正负链信息,可准确区分正义链和反义链转录本;其他选项与文库构建目的无关。
以下哪个数据库主要存储蛋白质三维结构信息?
A.GenBank
B.PDB(ProteinDataBank)
C.Ensembl
D.dbSNP
答案:B
解析:PDB是全球权威的蛋白质结构数据库;GenBank存储核酸序列,Ensembl提供基因组注释,dbSNP存储SNP信息。
单细胞RNA-seq中,“UMI(唯一分子标识符)”的主要功能是?
A.区分不同细胞
B.减少扩增偏倚
C.提高测序深度
D.标记细胞器
答案:B
解析:UMI是随机短序列标签,用于标记原始RNA分子,可校正PCR扩增过程中的偏好性,准确计数原始分子数量;区分细胞通常用细胞barcode,与UMI功能不同。
宏基因组学(Metagenomics)研究的主要对象是?
A.单一物种的完整基因组
B.环境样本中所有微生物的遗传物质
C.人类全外显子组
D.肿瘤体细胞变异
答案:B
解析:宏基因组学直接分析环境(如肠道、土壤)中所有微生物的混合DNA,无需分离培养单一物种;其他选项均针对特定物种或样本类型。
以下哪种算法常用于基因表达数据的降维分析?
A.BWA(Burrows-WheelerAligner)
B.PCA(主成分分析)
C.K-means
D.BLAST
答案:B
解析:PCA(主成分分析)是经典的降维算法,可将高维表达数据(如RNA-seq)转化为低维空间以便可视化;BWA用于序列比对,K-means是聚类算法,BLAST用于序列搜索。
生物信息分析中,“Q30”指标表示?
A.测序错误率≤0.1%的碱基比例
B.GC含量≥30%的区域比例
C.比对到参考基因组的reads比例≥30%
D.变异检测的置信度≥30
答案:A
解析:Q30表示测序碱基质量分数≥30,对应错误率≤0.1%(公式:Q=-10×log10(错误率));其他选项为干扰项。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于高通量测序技术的有?
A.IlluminaHiSeq
B.PacBioSMRT
C.Sanger测序
D.OxfordNanopore
答案:ABD
解析:Illumina(短读长、高准确性)、PacBio(长读长、单分子)、OxfordNanopore(长读长、便携式)均为高通量测序技术;Sanger测序是低通量的一代测序技术。
BAM文件通常包含以下哪些信息?
A.测序reads的序列
B.reads的质量分数
C.reads在参考基因组上的比对位置
D.剪接位点信息(如RNA-seq)
答案:ABCD
解析:BAM是SAM的二进制格式,包含reads序列(SEQ)、质量(QUAL)、比对位置(POS)、剪接标记(如RNA
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