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病毒性肝炎分子诊断技术进展综述
摘要
病毒性肝炎是由多种肝炎病毒引起的以肝脏损害为主的全身性传染病,严重威胁全球公共卫生安全。准确、及时的诊断是有效防控和治疗病毒性肝炎的关键。分子诊断技术以其高灵敏度、高特异性和快速检测等优势,已成为病毒性肝炎诊断、疗效监测及流行病学调查的重要手段。本文综述了近年来在病毒性肝炎(主要包括甲、乙、丙、丁、戊型肝炎)分子诊断技术方面的研究进展,重点讨论了聚合酶链式反应(PCR)及其衍生技术、核酸杂交技术、基因测序技术等的原理、应用现状及各自优缺点,并对未来分子诊断技术的发展趋势和面临的挑战进行了展望,旨在为病毒性肝炎的临床诊断和科研工作提供参考。
引言
病毒性肝炎是全球范围内重大的公共卫生问题,具有较高的发病率和死亡率,可导致肝硬化、肝衰竭和肝细胞癌等严重并发症。根据病毒基因组结构、传播途径和临床特征的不同,目前已明确的嗜肝病毒主要包括甲型肝炎病毒(HAV)、乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)、丁型肝炎病毒(HDV)和戊型肝炎病毒(HEV)。早期、准确地检测出这些病毒,并对其进行基因分型、病毒载量测定及耐药突变分析,对于疾病的早期诊断、治疗方案的选择、疗效评估以及疫情控制具有至关重要的意义。
传统的病毒性肝炎诊断方法主要依赖于血清学标志物检测,如抗原抗体检测等。虽然这些方法在临床应用中发挥了重要作用,但存在灵敏度不高、窗口期较长、无法直接反映病毒复制活性等局限性。随着分子生物学技术的飞速发展,以核酸检测为核心的分子诊断技术因其能够直接检测病毒核酸,具有更高的灵敏度和特异性,能够更早地发现感染,准确量化病毒载量,监测病毒变异和耐药性,从而在病毒性肝炎的诊断和管理中扮演着越来越重要的角色。
一、聚合酶链式反应(PCR)及其衍生技术
PCR技术是分子诊断领域的里程碑,其基本原理是通过模拟DNA体内复制过程,在体外快速扩增特定核酸片段。基于PCR原理,已发展出多种衍生技术,广泛应用于病毒性肝炎的检测。
(一)实时荧光定量PCR(qPCR)
实时荧光定量PCR(qPCR)是目前临床应用最广泛的病毒性肝炎分子诊断技术之一。该技术在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,并通过标准曲线对未知模板进行定量分析。qPCR具有以下优势:
1.高灵敏度和特异性:能够检测到极低拷贝数的病毒核酸,且能特异性识别不同病毒型别或亚型。
2.定量准确:可精确测定病毒载量,是评估抗病毒治疗疗效、判断预后的重要指标,尤其在HBV和HCV感染管理中不可或缺。
3.快速高效:相较于传统培养方法,检测时间大大缩短,通常可在数小时内获得结果。
4.闭管操作:减少了扩增产物污染的风险。
目前,qPCR已成为HBVDNA、HCVRNA定量检测的金标准,并广泛应用于HAV、HEV的核酸检测以及HDVRNA的定性和定量检测。针对不同病毒的基因特点,已开发出多种特异性引物和探针,如基于HBV保守区设计的引物可用于不同基因型HBV的检测,而HCV的基因分型检测对指导直接抗病毒药物(DAA)的选择具有重要价值。
(二)巢式PCR与半巢式PCR
巢式PCR和半巢式PCR通过两轮PCR扩增,使用内外两对引物,显著提高了检测的灵敏度和特异性。尤其适用于病毒载量极低或临床样本中存在PCR抑制物的情况,如在HCV感染的早期诊断、血清学标志物阴性的隐匿性HBV感染检测中具有一定应用价值。然而,其操作相对繁琐,易出现交叉污染,且定量能力有限,目前更多地被高灵敏度的qPCR或其他新兴技术所取代,但在某些特定研究场景或资源有限地区仍有应用。
(三)数字PCR(dPCR)
数字PCR(dPCR)是一种新兴的核酸绝对定量技术,其原理是将核酸样本分割成大量微小反应单元(如微滴或微室),在每个单元中进行独立的PCR扩增,最后通过计数阳性反应单元的数量来实现靶核酸的绝对定量,无需依赖标准曲线。dPCR具有以下特点:
1.绝对定量:不依赖标准品,定量结果更准确可靠,尤其在低病毒载量样本(如HBV低水平复制或治疗后残留病毒)的检测中优势明显。
2.高耐受性:对PCR抑制剂的耐受性较强,适合复杂基质样本的检测。
3.高分辨率:能够区分微小的浓度差异,在病毒准种分析、拷贝数变异研究等方面具有潜力。
目前,dPCR在HBVcccDNA的检测、抗病毒治疗终点的精确评估、以及低水平病毒血症的监测等方面展现出良好的应用前景,为探索病毒性肝炎的发病机制和优化治疗策略提供了新的工具。但dPCR成本较高,检测通量相对有限,其在临床常规应用中的普及尚需时日。
二、等温扩增技术
等温扩增技术无需复杂的热循环仪器,在恒定温度下即可实现核酸的快速扩增,具有操作简便、快速、成本相对较低等优点,适合基层医疗机构或现场快速检测(P
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