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课程背景与设计理念
在数字化浪潮与生命科学革命交汇的时代,本课例以高中信息技术(Python编程)与生物学(DNA结构)的交叉点为切入点,通过模拟生物信息学分析流程,培养学生计算思维与生命科学素养。课程严格遵循《普通高中信息技术课程标准》与《高中生物学课程标准》双重要求,实现数据分析-算法设计-科学验证的闭环学习。
三维教学目标
知识与技能
掌握DNA碱基序列的二进制编码原理
运用Python实现FASTA格式文件读写
开发简易的碱基互补配对程序
过程与方法
体验生物数据的计算建模过程
通过JupyterNotebook完成交互式实验
建立假设-编程-验证的科研思维
情感态度价值观
培养生物伦理意识与信息社会责任
激发对交叉学科的研究兴趣
理解信息技术对生命科学的革命性影响
教学实施流程(90分钟)
一、情境导入(15分钟)
现实案例展示
现实案例展示
播放CRISPR基因编辑技术视频:通过生动的动画演示,展示如何利用CRISPR-Cas9系统精准剪切DNA片段,解释该技术在遗传病治疗和农业育种中的革命性应用
展示新冠疫情期间病毒基因测序的IT支持:以武汉病毒研究所的案例为例,说明超级计算机如何加速病毒基因组分析,支撑疫苗研发的中国速度
引出问题:计算机如何读懂生命密码?:从ATCG碱基序列到蛋白质合成的生命密码本,探讨计算机科学在解码30亿个碱基对的人类基因组计划中的关键作用
认知冲突创设
认知冲突创设
分组讨论:用ASCII码表破译ATCG碱基的二进制表达\
学生以4-5人为单位,通过比对ASCII编码规范,将A、T、C、G四个碱基字母转换为二进制形式。教师引导思考:当计算机处理基因数据时,为何需要将生物信息转化为0/1信号?这种数字化表达如何影响基因测序效率?
教师演示Python读取线粒体DNA数据的可视化过程\
使用Biopython库加载线粒体基因组FASTA文件,通过Matplotlib绘制GC含量分布热力图。重点演示:①如何用collections.Counter统计碱基出现频率②三维空间映射ATCG序列的拓扑结构③动态展示DNA双螺旋的数据建模过程。引发学生讨论生物信息学中数据-模型-可视化的闭环逻辑。
二、核心实践(60分钟)
任务1:基因数字化(25分钟)
学生使用Biopython库加载果蝇基因片段
编写转换函数实现:
defdna_to_binary(sequence):returnsequence.replace(A,00).replace(T,11)...
小组竞赛:最快完成人类染色体1号片段编码
任务2:智能配对(35分钟)
引入哈佛大学公开的端粒酶RNA序列
开发智能配对算法:
defcomplementary(seq):returnseq.translate(str.maketrans(ATCG,TAGC))
拓展挑战:检测基因突变位点(需考虑插入/缺失突变)
三、总结提升(15分钟)
跨学科反思
跨学科反思
生物学视角:DNA半保留复制的程序化表达\
这一生物学核心机制展现了遗传信息传递的精密性:亲代DNA双链解旋后,每条单链作为模板合成互补链,最终形成两个与亲代完全相同的子代DNA分子。该过程涉及解旋酶、DNA聚合酶等多种蛋白质的协同作用,体现了生命系统分子层面的程序化运作特征。
信息学视角:生物数据的结构化特征\
生物信息呈现多层次的组织架构:从碱基对的线性序列到蛋白质的三维构象,从基因表达调控网络到生态系统物质能量流动,均遵循特定的编码规则和逻辑关系。这种结构化特性使得海量生物数据可通过计算模型进行解析,例如基因组注释中的ORF识别、蛋白质相互作用预测等。
社会议题探讨
社会议题探讨
分组辩论:基因大数据应用的伦理边界\
围绕基因数据隐私权、商业开发权限等核心争议点展开讨论,例如:医疗机构是否有权将患者基因数据用于药物研发?保险公司能否根据基因风险调整保费?通过正反方观点交锋引导学生思考技术发展与伦理约束的平衡。
展示华大基因的超级计算机应用实例\
以新冠毒株进化预测为例,演示如何通过超算分析海量基因序列:①实时追踪病毒变异位点②建立传播动力学模型③辅助疫苗靶点设计。强调算力突破对公共卫生决策的关键支撑作用。
教学评价设计
过程性评价
Git版本控制记录编程迭代过程
实验报告中的错误处理分析(如遇到终止密码子)
成果性评价
程序功能实现度(40%)
生物学原理阐释准确性(30%)
创新性应用方案(30%)
教学资源清单
数据集:NCBI提供的简化版流感病毒基因组
软件:Anaconda环境下的JupyterLab
硬件:树莓派生物信息学学习套件
参考:MIT《Pythonfor
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