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;1.PCR循环图示及规律;2.PCR中的数量关系;3.利用RT-PCR技术进行RNA病毒的核酸检测
(1)RT-PCR技术(逆转录荧光PCR技术)
①先从样本中提取RNA,RNA中可能有某病毒的RNA,同时也存在很多采样患者的组织和存在于采样部位的微生物的RNA。
②先通过逆转录酶将样本的RNA逆转录为cDNA。因为病毒中的核酸为RNA,而RNA极易降解,为了防止检测的物质在检测过程中降解,把它转换为更稳定的DNA。;③检测扩增出的PCR产物,即DNA片段。扩增的病毒DNA片段能够发出荧光而被仪器检测到。这些扩增出的供检测的产物的多少,很大程度上取决于样本中目标RNA量的多少。而目标RNA量的多少又与样本中病毒的多少相关。;(2)荧光探针法(TaqMan技术)是临床检测中最常用的检测方法。PCR扩增时,加入一对引物的同时再加入一个特异性的荧光探针。该探针是一个寡核苷酸,5′端标记一个荧光报告基团(Reporter,R),3′端标记一个淬灭基团(Quencher,Q)。当探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收,以至于无法检测到荧光信号;而当PCR扩增时(在延伸阶段),探针会被TaqDNA聚合酶的5′→3′外切酶活性酶切降解,使报告基团和淬灭基团分离,报告基团发射的荧光不会再被吸收,从而可以在荧光监测系统接收到荧光信号,即每扩增一条DNA,就形成一个荧光分子,PCR产物的形成与荧光分子的形成完全同步,PCR产物越多,荧光信号累积的越多,荧光强度越大。如图所示:;荧光定量PCR仪能够监测出荧光到达预先设定阈值的循环数(Ct值)与病毒核酸浓度有关,病毒核酸浓度越高,Ct值越小。Ct40或无Ct值判定为阴性。;4.CRISPR/Cas9结合PCR
CRISPR/Cas9系统是一种革命性的基因组编辑技术,其原理是由一条单链向导RNA(SgRNA)引导限制性内切核酸酶Cas9到一个特定的基因位点进行切割(如图)。CRISPR复合体中的SgRNA的主要功能是与靶向基因(目的基因)上特定碱基序列互补,从而定向引导Cas9蛋白与靶向基因结合,并在特定位点切割DNA。;通过扩增特定的基因片段,并将其插入目标基因中,可以实现对基因的敲除或敲入,为研究基因功能提供有力手段。将CRISPR/Cas9系统与PCR技术结合,可以实现对特定基因的高效编辑和检测。;1.(2024·河北部分高中模拟)现如今随着技术的不断发展,人们发明了多种PCR技术的衍生版本,如重叠延伸PCR、等位基因特异PCR、热不对称性PCR、荧光定量PCR、锅柄式PCR等。这些新技术在不同层面对传统PCR技术进行了较完善合理的改进。下列有关PCR的叙述正确的是()
A.已知重叠延伸PCR可将两个或多个DNA片段连接起来,因此可用于较长DNA分子的人工合成
B.已知等位基因特异PCR可鉴定出两个基因中单核苷酸的差异,因此可用于病毒的检测与分析;C.已知热不对称性PCR可通过调节退火温度产生多种产物,因此操作时对温度的要求低于常规PCR
D.已知荧光定量PCR可将扩增的结果表现为便于观察的荧光信号,因此可用于亲子鉴定;A[重叠延伸PCR可将两个或多个短DNA连接成一个长DNA,可以将人工合成的短DNA合成为目标长DNA,A正确;等位基因特异PCR可鉴定出两个基因中单核苷酸的差异,可用于亲子鉴定以及遗传病的筛查,无法检测是否存在某种病毒,B错误;热不对称性PCR需对温度进行精细控制,对温度的要求高于常规PCR,C错误;荧光定量PCR可将扩增的结果表现为便于观察的荧光信号,可用于某些病毒的检测,无法判断两份DNA间的细微差别,因此无法用于亲子鉴定,D错误。];2.(不定项)(2024·湖南岳阳模拟)实时荧光RT-PCR用于RNA病毒的核酸检测,其原理是在PCR复性过程中探针和引物一起与模板结合,探针两侧分别带有荧光基团和抑制荧光发出的淬灭基团,新链延伸过程中,DNA聚合酶会破坏探针,导致荧光基团与淬灭基团分离而发出荧光,如图所示。下列有关叙述正确的有();A.与细胞内DNA复制相比,该技术用的DNA聚合酶最适温度较高
B.通过温度变化的控制为变性、复性和延伸等过程提供能量
C.该过程中消耗引物的量与发出的荧光强度之间呈负相关
D.与抗体检测相比,核酸检测能更早发现患者并及时治疗;AD[实时荧光RT-PCR过程温度要高于体温,A正确;温度不能为变性、复性和延伸等过程提供能量,B错误;复性过程中探针和引物一起与模板结合,故消耗引物的量与发出的荧光强度之间呈正相关,C错误;从感染病毒到抗体产生,需要一定的免疫时间,所以与抗体检测相比,核酸检测能更早发现患者并及时治疗,D正确。];3.(2024·全国新课标卷)某研究小组将纤维素酶基因(N)插入某种细菌(B1)的基因组中,构建高效降
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