第3讲蛋白质结构体系.pptxVIP

第3讲蛋白质结构体系;一级结构

;Image:Lysozymecrystal;两个ahelices互相缠绕，侧链互相齿合，形成一个左手螺旋，周期距离为14nm。

大多数疏水侧链分布在螺旋的同一侧，并埋藏在两个螺旋的接触面上。两个螺旋借疏水侧链的疏水作用而互相结合，自由能很低。因此，复绕?-螺旋很稳定。;螺旋可以组合成更复杂的结构;由两条平行的?-折叠股，通过一个?结构的连接，称为???-单元。;???-单元(???-unit);???-单元(???-unit);???-单元(???-unit);?-迂回(?-meander);?-迂回(?-meander);?-迂回(?-meander);?-折叠筒(?-sheetbarrel);?-折叠筒(?-sheetbarrel);螺旋-转折-螺旋(helix-loop/turn-helix);螺旋-转折-螺旋(helix-loop/turn-helix);螺旋-转折-螺旋(helix-loop/turn-helix);螺旋-转折-螺旋(helix-loop/turn-helix);α-环/转折-α模体（helix-loop/turn-helix）;关于EFhand钙结合蛋白的数据库见，这个数据库收集了目前发现的所有EF-HandCalcium-BindingProteins的序列、结构、功能及其他相关信息及它们在信号转导中的作用，同时提供分析工具。;锌指结构(Zinc-fingerstructure);TFⅢA，它是5SrRNA基因转录激活因子，结合50bp5SrRNA编码基因的内调控区。含有9个相同的锌指结构。;这种结构的特点是蛋白质分子的肽链上每隔6个氨基酸就有一个亮氨酸残基，这些亮氨酸残基都在?-螺旋的同一个方向出现，有如日常使用的拉链结构，故称之为亮氨酸拉链。两个相同结构的两排亮氨酸残基就能以疏水键结合成二聚体，二聚体另一端的肽段富含碱性氨基酸残基，借其正电荷与DNA双螺旋链上带负电荷的磷酸基团结合。;结构域(Domain);结构域(Domain);Hexokinase具有两个结构域一个功能域;结构域(Domain);注意：

不要将domain与亚基(subunit)混淆：例如hemoglobin由四个亚基所组成，是四个独立的蛋白质，而每个亚基各含有一个domain，但有四个亚基不能说是含有四个domains。;抗体具有十二个以上的结构域;;外型结构相似的桶状大分子却有相反的作用;;类似的蛋白质区域经常被重复使用;ComparisonofDNA-bindinghomeodomainsfromtwoorganismsseparatedbymorethanabillionyearsofevolution.????(A)Schematicofstructure.(B)Traceofthealpha-carbonpositions.Thethree-dimensionalstructuresshownweredeterminedbyx-raycrystallographyfortheyeastalpha2protein(green)andtheDrosophilaengrailedprotein(red).(C)Comparisonofaminoacidsequencesfortheregionoftheproteinsshownin(A)and(B).Orangedotsdemarkthepositionofathreeaminoacidinsertinthealpha2protein.;更复杂的domain互用关系;结构域(Domain);allahelices;数个ahelices可聚在一起;KleinsmithKish(1995)PrinciplesofCellandMolecularBiology(2e)p.26;KleinsmithKish(1995)PrinciplesofCellandMolecularBiology(2e)p.26;结构域(Domain);二级结构组合成三级结构;结构域-模体和结构域的区别;谢谢