上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒F基因遗传进化及生物信息学分析.pdfVIP

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上海地区鸽Ⅰ型副黏病毒F基因遗传进化及生物信息学分析.pdf

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中国畜牧兽医,():

5150-5161

ChinaAnimalHusbandrVeterinarMedicine

上海地区鸽型副黏病毒基因遗传

ⅠF

进化及生物信息学分析

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刘健周锦萍沈莉萍桂亚萍葛菲菲王晓旭杨显超刘佩红王建

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1.上海市动物疫病预防控制中心上海2011032.上海市农业科学院上海201106

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摘要目的了解上海地区鸽型副黏病毒流行毒株基因遗传变异情况分析蛋白生物信息学

ⅠPPMV-1FF

,。【】,

特征为的防控提供技术支持方法应用方法扩增分离株基因测序并进行遗传进化分

PPMV-1RT-PCRF

,。【】,

析并通过生物信息学在线软件对蛋白结构功能进行预测分析结果分离株基因编码区全长为

FF1662bp

,,。

编码个氨基酸蛋白裂解位点序列为符合强毒株序列结构特征系统进化树分析结果

553F112R-R-Q-K-R-F117

,(),

显示分离株属于新城疫病毒群亚型与疫苗株和处于不同进化

NDVClassⅡⅥ..2LaSotaMukteswar

,///////。

分支与国内分离株和同属分支生物信息学分

PiSHCHieonNinxiⅥ..2

pgg

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析结果表明蛋白为亲水性蛋白分子质量约为理论等电点为半衰期为不稳定系数为

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