河南省猪细小病毒2型流行特征和遗传进化分析.pdfVIP

中国兽医杂志2024,60(9）：23-29

ChineseJournalofVeterinaryMedicine

D01:10.20157/j.cnki.zgsyzz.2024.09.003

河南省猪细小病毒2型流行特征

和遗传进化分析

许夕雅，韩紫薇，杨寒，高冬生，王永生，陈陆

（河南农业大学动物医学院，河南郑州450046）

摘要：为了解河南省猪细小病毒2型（PPV2）的遗传进化和流行特征，本试验对2021一2022年河南省不同地区猪养殖

场送检的759份临床样品进行PCR检测，选取4份不同地区的PPV2阳性样品，对其进行全基因组测序，并与35条国内外

PPV2参考序列进行同源性分析、系统发育分析和重组分析。结果显示，送检临床样品PPV2检出率为15.81%（120/759），

与猪细小病毒7型（PPV7）、猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒（PRRSV）和猪圆环病毒2型（PCV2）的混合感染率依次为

35.83%、25.00%和20.83%。鉴定的4株PPV2分别命名为PPV2XM-15/2021、PPV2ZMD-20/2021、PPV2ZK-9/2021和

PPV2SQ-16/2021。4株PPV2鉴定株的全基因组核苷酸同源性为95.0%~99.7%，处在不同进化分支，亲缘性较远，与35株

PPV2参考株的全基因组核苷酸同源性为93.9%~99.8%、NS基因核苷酸和氨基酸同源性均为92.6%~99.8%、Cap基因

核苷酸和氨基酸同源性均为88.7%~100%。PPV2ZMD-20/2021株、PPV2ZK-9/2021株和PPV2SQ-16/2021株可能为重组

毒株。结果表明，河南省猪场PPV2检出率较高，且与多种病原混合感染，其中与PPV7混合感染最常见；PPV2遗传进化差

异较大，存在重组现象，且重组位置不唯一。

关键词：猪细小病毒2型；全基因组；流行特征；遗传进化分析；重组分析

中图分类号：S852.65文献标志码：A文章编号：0529-6005(2024)09-0023-07

EpidemiologicalCharacteristicsandGeneticEvolutionAnalysisof

PorcineParvovirusType2inHenanProvince

XUXiya,HANZiwei,YANGHan,GAODongsheng,WANGYongsheng,CHENLu

(CollegeofVeterinaryMedicine,HenanAgriculturalUniversity,Zhengzhou450046,China)

Abstract:Tounderstandthegeneticevolutionandepidemiologicalcharacteristicsofporcineparvovirustype2(PPV2)inHenan

Province,759clinicalsamplessentfromdifferentpigfarmsinHenanProvinceweretestedbyPCRfrom2021to2022.FourPPV2-

positivesamplesfromdfferentregionswereselectedforwhole-genomesequencing.Homologyanalysis,phylogeneticanalysis,and

recombinationanalysiswereconductedwith35domesticandinternationalPPV2referencesequences.Theresultsshowedthatthe

detectionrateofPPV2inthetestedclinicalsampleswas15.81%(120/759),wi