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山西农业科学2025,53(4):109-120JournalofShanxiAgriculturalSciences
崔丽艳,杨佼丽,柳建丽,等.大豆花叶病毒山西半夏分离物全基因组序列分析[J].山西农业科学,2025,53(4):109-120.
CUILY,YANGJL,LIUJL,etal.AnalysisofthecompletegenomesequenceofsoybeanmosaicvirusshanxiPinelliaternataiso⁃
late[J].JournalofShanxiAgriculturalSciences,2025,53(4):109-120.
doidoi:10.26942/j.cnki.issn.1002-2481.2025.04.13
大豆花叶病毒山西半夏分离物全基因组序列分析
1123111
崔丽艳,杨佼丽,柳建丽,侯钥,郭成英,王德富,牛颜冰
(1.山西农业大学生命科学学院,山西晋中030801;2.晋城市现代农业发展中心,山西晋城048000;
3.陵川县中药材产业发展中心,山西陵川048300)
摘要:大豆花叶病毒(SMV)在大豆生产中会造成产量和品质的严重下降,具有传播广泛和致病性强的特点,
但宿主范围相对较窄,以豆科植物为主。近年来研究却表明,SMV能够跨科侵染天南星科植物半夏(Pinellia
ternata)。为明确侵染山西半夏的大豆花叶病毒分离物(SMV-SXBX)的基因组特征,采用生物信息学软件对
侵染山西半夏的SMV-SXBX进行了序列相似性分析、系统进化分析、氨基酸功能位点分析和重组分析。序列
相似性分析结果表明,SMV-SXBX与SMV-Hangzhou分离物(GenBank登录号:AJ507388.2)的相似性最高,核
苷酸序列相似性为92.09%,氨基酸序列相似性为95.91%;系统进化分析结果显示,SMV-SXBX与SMV-
Hangzhou分离物聚为一簇,亲缘关系最近。在SMV-SXBX基因组中,P1蛋白的序列差异性最大,核苷酸和氨
基酸序列差异性分别为34.93%和36.28%。突变与氨基酸功能分析结果表明,SMV-SXBX氨基酸序列中存在
多个氨基酸突变位点;重组分析结果表明,SMV-SXBX在3056—6895bp处有重组事件的发生,主要亲本为
SMV-HZ1分离物(GenBank登录号:AJ628750.1),次要亲本为SMV-XFQ008分离物(GenBank登录号:
KP710873.1)。综上研究结果,明确了SMV-SXBX的基因组特征,其发生的氨基酸突变及基因重组可能是导
致大豆花叶病毒跨科侵染半夏的原因之一。
关键词:大豆花叶病毒;半夏;全序列分析;系统进化分析;氨基酸功能位点分析;重组分析
中图分类号S435.67文献标识码A文章编号1002‒2481(2025)04‒0109‒12
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AnalysisoftheCompleteGenomeSequenceofSoybeanMosaic
VirusShanxiPinelliaternataIsolate
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