油果樟叶绿体基因组特征及系统进化分析.pdfVIP

第46卷第5期青岛科技大学学报（自然科学版）Vol.46No.5

2025年10月JournalofQingdaoUniversityofScienceandTechnology（NaturalScienceEdition）Oct.2025

文章编号：1672-6987（2025）05-0010-09；DOI：10.16351/j.1672-6987.2025.05.002

油果樟叶绿体基因组特征及系统进化分析

陆永杰1，石文博1，宋维才1，施超1，2*

（1.青岛科技大学生物工程学院，山东青岛266042；

2.中国科学院昆明植物研究所中国西南野生物种种质资源库植物种质与基因组学中心，云南昆明650204）

摘要：油果樟（SyndiclischinensisC.K.Allen）作为珍稀濒危物种，其叶绿体基因组研究

对生物多样性保护具有重要意义。本工作通过高通量测序首次获得其完整叶绿体基因组

（160286bp，GC含量39%），呈现典型环状四分体结构：LSC（89335bp）、SSC（24623bp）及

IRs（各23165bp）。共注释出127个基因，含82个蛋白编码基因、37个tRNA和8个rRNA基

因，其中44个基因参与光合作用，70个涉及自我复制，其余功能基因及未知基因各6个。SSR

分析鉴定出235个多态性位点，单核苷酸重复占比73.6%（A/T主导）。系统发育树显示油果

樟与同属物种形成高支持率进化分支，并与琼楠属亲缘关系较近。本研究首次揭示油果樟叶

绿体基因组特征，为其种群遗传演化研究提供分子生物学依据。

关键词：油果樟；叶绿体基因组；基因组结构；密码子偏好性；系统发育分析

中图分类号：Q751文献标志码：A

引用格式：陆永杰，石文博，宋维才，等.油果樟叶绿体基因组特征及系统进化分析［J］.青

岛科技大学学报（自然科学版），2025，46（5）：10-18.

LUYongjie，SHIWenbo，SONGWeicai，etal.Characterizationandphylogeneticanalysisof

thecompletechloroplastgenomeofSyndiclischinensis［J］.JournalofQingdaoUniversityof

ScienceandTechnology（NaturalScienceEdition），2025，46（5）：10-18.

CharacterizationandPhylogeneticAnalysisoftheComplete

ChloroplastGenomeofSyndiclisChinensis

1111，2

LUYongjie，SHIWenbo，SONGWeicai，SHIChao

（1.CollegeofBioengineering，QingdaoUniversityofScienceandTechnology，Qingdao266042，China；

2.PlantGermpl