基于SNP分子标记技术的杭锦旗甘草指纹图谱构建.pdfVIP

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20254441-8.httSeedVol.44No.4Ar.2025

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·研究报告·

基于SNP分子标记技术的杭锦旗甘草指纹图谱构建

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潘雨晴赵心阳张飞飞段妍妮李雅丽

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内蒙古科技大学生命科学与技术学院内蒙古包头

014000

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摘要杭锦旗特有的地理环境和气候条件赋予了当地甘草皮色红粉性足含酸多切面光等优良特性成为我国乌拉

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尔甘草的典型代表目前杭锦旗流通的甘草种子50%以上品种混杂遗传背景不明确给道地甘草资源的鉴定保护等

。,

工作造成困难以在杭锦旗境内不同地理居群收集的野生甘草种子为研究对象利用全基因组重测序技术以及Illumi-

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测序平台开发位点获得的测序结果为为经过测序结果与参考

naSNPQ2097.14%~98.81%Q3092.60%~93.80%

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基因组比对筛选共获得个标记位点这些变异位点次等位基因频率平均值为

SNPSNPMAF0.16SNP

。,

标记多态性信息含量平均值为通过多个指标筛选原始位点最终获得来自份样本的能够鉴定杭锦旗甘

0.235SNP28

,。,

草的个标记构建了相应的指纹图谱并进行了相关的遗传进化分析结合交叉验证错误率结果认为这

368SNPDNA

。,、、。

个样本有个原始祖先从个主成分中最终确定个主成分分别为

282283PC1PC2PC3

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关键词甘草分子标记遗传进化分析指纹图谱

SNP

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DOI10.16590.cnki.1001-4