‘金如意’山楂叶绿体基因组特征与系统进化分析.pdfVIP

山东农业科学２０２５ꎬ５７(８):２４~３４ＳｈａｎｄｏｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ

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ＤＯＩ:１０.１４０８３/ｊ.ｉｓｓｎ.１００１４９４２.２０２５.０８.００４

‘金如意’山楂叶绿体基因组特征与系统进化分析

１ꎬ２２２２２２３１２

林冉冉ꎬ王宏伟ꎬ焦慧君ꎬ董肖昌ꎬ关秋竹ꎬ魏树伟ꎬ聂宗省ꎬ张玮玮ꎬ冉昆

(１.山东农业大学园艺科学与工程学院ꎬ山东泰安２７１０１８ꎻ２.山东省果树研究所ꎬ山东泰安２７１０００ꎻ

３.山东如燚农业科技发展有限公司ꎬ山东新泰２７１２００)

摘要:本研究以‘金如意’山楂叶片为材料ꎬ利用Ｉｌｌｕｍｉｎａ高通量测序技术对其叶绿体基因组进行测序ꎬ对

序列进行组装和分析ꎬ并对３４种蔷薇科植物的叶绿体基因组进行系统进化分析ꎮ结果表明ꎬ‘金如意’山楂

叶绿体基因组全长１５９６５５ｂｐꎬＧＣ含量３６.６５％ꎬ包含一个８７７４８ｂｐ的大单拷贝(ＬＳＣ)区、一个１９１３９ｂｐ的

小单拷贝(ＳＳＣ)区和一对２６３８４ｂｐ的反向重复(ＩＲ)区ꎻ共编码１３０个基因ꎬ包括８５个蛋白编码基因、３７个

ｔＲＮＡ基因和８个ｒＲＮＡ基因ꎻ共检测到２６４个ＳＳＲ位点和５７个重复序列ꎬ其中ＳＳＲ位点大部分由Ａ和Ｔ重

复碱基组成ꎻ高频密码子(ＲＳＣＵ１)有３１个ꎬ其中以Ａ/Ｕ结尾的有２９个ꎻ与其他蔷薇科植物相比ꎬ‘金如意’

山楂叶绿体基因组ＩＲ区边界相对保守ꎮ系统进化分析表明ꎬ‘金如意’山楂与大果山楂(Ｃｒａｔａｅｇｕｓｐｉｎｎａｔｉｆｉｄａ

ｖａｒ.ｍａｊｏｒ)亲缘关系最近ꎬ属于大果山楂类型ꎮ研究结果可为山楂种质资源鉴定、遗传多样性研究和资源开

发利用奠定基础ꎮ

关键词:‘金如意’山楂ꎻ叶绿体基因组ꎻ系统进化分析

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中图分类号:Ｓ６６１.５:Ｑ７８４文献标识号:Ａ文章编号:１００１４９４２(２０２５)０８００２４１１

ＣｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎａｎｄＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＣｏｍｐｌｅｔｅＣｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ

ＧｅｎｏｍｅｏｆＣｒａｔａｅｇｕｓｐｉｎｎａｔｉｆｉｄａＢｇｅ.ｖａｒ.ｍａｊｏｒＪｉｎｒｕｙｉ

１ꎬ２２２２２２

ＬｉｎＲａｎｒａｎꎬＷａｎｇＨｏｎｇｗｅｉꎬＪｉａｏＨｕｉｊｕｎꎬＤｏｎｇＸｉａｏｃｈａｎｇꎬＧｕａｎＱｉｕｚｈｕꎬＷｅｉＳｈｕｗｅｉꎬ

３１２

ＮｉｅＺｏｎｇｓｈｅｎｇꎬＺｈａｎｇＷｅｉｗｅｉꎬＲａｎＫｕｎ

(１.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＨｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇꎬＳｈａｎｄｏｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＴａｉａｎ２７１０１８ꎬＣｈｉｎａꎻ２.ＳｈａｎｄｏｎｇＩｎｓｔｉｔｕｔｅ

ｏｆＰｏｍｏｌｏｇｙꎬＴａｉａｎ２７１０００ꎬＣｈｉｎａꎻ３.ＳｈａｎｄｏｎｇＲｕｙｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔＣｏ.ꎬＬｔｄ.ꎬＸｉｎｔａｉ２７１２００ꎬＣｈｉｎａ)

ＡｂｓｔｒａｃｔＵｓｉｎｇｔｈｅｌｅａｖｅｓｏｆＣｒａｔａｅｇｕｓｐｉｎｎａｔｉｆｉｄａＢｇｅ.ｖａｒ.ｍａｊｏｒＪｉｎｒｕｙ