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生物技术通报
·研究报告·BIOTECHNOLOGYBULLETIN2025,41(7):117-127
花生4CL基因家族鉴定及对干旱与盐胁迫响应分析
张泽杨秀丽宁东贤
(山西农业大学小麦研究所,临汾041000)
摘要:【目的】分析花生4-香豆酸:CoA连接酶(4-coumarate:CoAligase,4CL)基因家族成员基本特性及其对干旱和盐胁
迫的响应,为培育花生耐旱抗盐品种提供重要的目标基因。【方法】通过HMM文件及NCBICDD和Pfam数据库在全基因组水平鉴
定花生4CL基因家族成员;利用ExPASy-ProtParam工具进行蛋白理化性质分析;通过MEGA7及itol工具进行系统进化分析;通过
MEME及NCBI中的CD-search工具进行蛋白保守基序和保守结构域分析;通过PlantCARE及TBtools进行启动子元件分析及可视化;
通过RNA-seq数据及RT-qPCR分析花生4CLs转录水平变化。【结果】借助花生Tifrunner基因组参考数据,鉴定到56个花生4CL基
因,氨基酸长度介于239‒1208之间,pI介于5.5‒9.22之间,蛋白脂肪系数介于80.2‒103.13之间,不稳定性指数在25.51‒48.79之
间,GRAVY值在-0.367‒0.139之间;花生A与B基因组的20条染色体上,Ah4CLs基因不均匀地分布,5和15号染色体Ah4CLs基因
密度最高;同一个聚类分支,Ah4CLs具有相似的保守基序组成及相似的内含子‒外显子分布结构,外显子数量在1‒18之间;
Ah4CLs启动子区域富含光、非生物胁迫、激素及生长发育响应元件;Ah4CLs表达具有组织特异性,在根、花及种子中表达量较
高;在ABA、盐与干旱胁迫处理下,部分Ah4CLs转录水平显著增加,特别是Ah4CL28在ABA、干旱及盐处理下均明显转录上调,
这些基因在花生应对非生物胁迫中可能发挥着重要作用。【结论】鉴定到的56个花生4CL基因家族成员有不同结构与特性,在部分
基序及结构域上具有保守型,Ah4CLs在影响花生生长发育的同时,还参与非生物胁迫响应。
关键词:花生;4CL基因;基因家族;进化分析;共线性分析;启动子分析;干旱胁迫;盐胁迫
DOI:10.13560/ki.biotech.bull.1985.2024-1266
Identificationof4CLGeneFamilyinArachishypogaeaL.and
ExpressionAnalysisinResponsetoDroughtandSaltStress
ZHANGZeYANGXiu-liNINGDong-xian
(InstituteofWheatResearch,ShanxiAgriculturalUniversity,Linfen041000)
Abstract:【Objective】Toanalyzethebasiccharacteristicsofpeanut4CL(4-coumarate:CoAligase)genefamilymembersandtheir
responsestodroughtandsaltstressinordertoprovideimportanttargetgenesforbreedingpeanutvarietiestol
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