2025年大学《生物信息学》专业题库—— 蛋白质结构预测及其在分子设计中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——蛋白质结构预测及其在分子设计中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分。请将正确选项字母填入括号内）

1.蛋白质的三级结构主要是指？

(A)氨基酸序列的线性排列

(B)α-螺旋和β-折叠等二级结构单元的排列方式

(C)整个蛋白质分子独特的空间构象

(D)蛋白质亚基的聚合状态

2.下列哪种方法属于基于模板的结构预测？

(A)肽链折叠算法

(B)跨域建模

(C)基于物理的能量最小化

(D)蛋白质序列比对寻找相似模板

3.SWISS-MODEL数据库主要提供哪种类型的服务？

(A)原始蛋白质结构数据提交

(B)基于AlphaFold2的实时结构预测

(C)基于同源建模的蛋白质结构预测

(D)蛋白质功能的自动化注释

4.AlphaFold2的主要突破在于其采用了什么核心技术？

(A)增量同源建模

(B)基于物理的能量函数优化

(C)基于自监督学习的多任务神经网络

(D)分子动力学模拟

5.蛋白质结构预测中，模板质量对同源建模结果的影响是？

(A)通常不重要，只要模板存在即可

(B)非常重要，高质量模板能显著提高预测精度

(C)与序列相似度无关

(D)主要影响二级结构预测，对整体三维结构影响不大

6.在结构导向药物设计中，分子对接的主要目的是？

(A)预测蛋白质的二级结构

(B)计算蛋白质的绝对构象能量

(C)寻找能与目标蛋白质活性位点有效结合的小分子

(D)预测蛋白质的溶解度

7.蛋白质工程的根本目标是？

(A)预测新的蛋白质结构

(B)设计新的蛋白质折叠途径

(C)改变或创造蛋白质的特定功能

(D)提高蛋白质的表达水平

8.蛋白质结构中的“口袋”通常指的是？

(A)非常开放的溶剂接触表面

(B)蛋白质内部疏水核心区域

(C)蛋白质表面具有特定形状和化学性质的凹陷区域，常为配体结合位点

(D)蛋白质多链聚集形成的空隙

9.与基于物理的能量学方法相比，基于深度学习的结构预测方法的主要优势在于？

(A)更深入地揭示物理化学原理

(B)能处理更复杂的序列和结构特征，精度通常更高

(C)计算速度更快，资源消耗更低

(D)更容易解释模型内部的决策过程

10.将一个蛋白质的活性位点残基替换为其他氨基酸，以改变其催化活性或结合能力，这属于哪种蛋白质设计策略？

(A)修饰蛋白质表面以改变其抗原性

(B)改变蛋白质的亚基组成

(C)引入disulfidebond以稳定特定构象

(D)疏水核心突变

二、填空题（每空1分，共15分。请将答案填入横线处）

1.蛋白质的______结构是指氨基酸残基连接而成的线性序列。

2.蛋白质的______结构是指蛋白质分子中原子间的相对空间位置。

3.常用的蛋白质结构预测服务器__________和__________提供了基于同源建模的在线工具。

4.AlphaFold2模型主要包含一个用于预测蛋白质结构的核心模型__________和一个用于预测二级结构的辅助模型__________。

5.结构导向药物设计通常需要结合__________技术来确定小分子与蛋白质的结合模式。

6.通过改变蛋白质氨基酸序列来改变其结构与功能的技术称为__________。

7.蛋白质工程的基本原理是：设计突变-表达蛋白质-________-评估效果。

8.在蛋白质结构中，氨基酸侧链暴露在溶剂中时主要表现为__________性质。

9.分子对接中，评估分子与蛋白质结合亲和力的常用评分函数包括__________和__________等。

10.蛋白质结构预测领域近年来最重要的进展之一是__________模型的提出。

三、简答题（每题5分，共20分）

1.简述同源建模的基本原理及其主要步骤。

2.比较基于物理的能量学方法和基于深度学习的蛋白质结构预测方法的主要区别。

3.简述分子对接在药物设计中的作用及其主要流程。

4.解释什么是蛋白质工程的“理性设计”原则。

四、论述题（每题10分，共20分）

1.论述AlphaFold2的提出对生物信息学和结构生物学领域可能产生的影响。

2.结合具体实例，论述蛋白