内蒙古牛冠状病毒全基因组测序与遗传进化分析.pdfVIP

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2025-11-06 发布于江西
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内蒙古牛冠状病毒全基因组测序与遗传进化分析.pdf

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中国畜牧兽医,():

4984-4995

ChinaAnimalHusbandrVeterinarMedicine

内蒙古牛冠状病毒全基因组测序与遗传进化分析

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其勒木格王旭芬侯琳张嘉磊马聿田张志丹周伟光

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1.内蒙古农业大学兽医学院呼和浩特0100182.农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018

:【】(,)

摘要目的了解内蒙古地区牛冠状病毒流行毒株的全基因组特征和遗传进化情

BovinecoronavirusBCoV

,。【】

况为有效防控BCoV感染提供参考方法本研究对疑似感染BCoV的犊牛脾脏进行宏病毒组测序和步移RT-

,,。

PCR扩增获得BCoV全基因组序列并对其进行生物信息和遗传进化分析利用Olio7.0软件设计特异性引物

,、、。【】

扩增基因并对其进行遗传进化氨基酸序列变异抗原表位预测及三级结构预测分析结果本研究从疑似感

染的犊牛脾脏中成功获得大小为的全基因组序列登录号为该全基因

BCoV30971bBCoVNCBIPP352170.1

,,,

组核苷酸序列与BCoV爱尔兰株ABGEB0-62相似性最高为99.2%并与该株亲缘关系最近同时与BCoV法国

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株和挪威株属于同一进化分支扩增出的基因核苷酸长度为与

BCoV201413Nes2012-01-03S4092bpBCoV

爱尔兰株ABGEB0-62S基因序列亲缘关系最近处于同一进化分支但核苷酸序列与BCoV内蒙古株NMG1S基

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因相似性最高为

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