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2025-11-06 发布于江西
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藜麦MADS-box基因家族的全基因组鉴定和表达分析.pdf

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生物技术通报

·研究报告·BIOTECHNOLOGYBULLETIN()

2025,411:157-172

藜麦-基因家族的全基因组鉴定和表达分析

MADSbox

何财林卢晶郭会会李小安吴琪

（1.农业农村部杂粮加工重点实验室成都大学食品与生物工程学院，成都610106；2.四川省杂粮产业化工程技术研究中心成都大学食品

与生物工程学院，成都610106）

摘要：目的开展藜麦-基因家族鉴定和表达分析，为藜麦产量品质的提高提供优异基因资源。方法基于

【】CqMADSbox【】

拟南芥MADS-box蛋白序列，利用BLASTP和隐马尔可夫模型文件（HiddenMarkovModel,HMM）鉴定-基因家族成员，

CqMADSbox

采用最大似然法（maximumlikelihood,ML）构建系统发育树，分析-基因在染色体的位置，利用MXSCan分析-

MADSboxCqMADS

基因家族成员在藜麦亚基因组A/B间，及其与甜菜二倍体近缘种（）、（），六倍体近缘种中国台湾

boxC.pallidicauleAC.suecicumB

红藜（）中-成员的共线性，利用WoLFPSORT、PlantCARE等在线网站分析-转录因

ChenopodiumformosanumMADSboxCqMADSbox

子的理化性质、基因结构、启动子区顺式作用元件。基于前期发表的转录组数据，分析-在不同组织、6个花序发育时

CqMADSbox

期、种子萌发的表达模式；利用转录组数据分析在长日照和短日照下，花期和花器官相关-的表达情况。结果鉴定

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