梨亚科5个属S-RNase基因的序列特征及进化分析.pdfVIP

果树学报2025，42（3）：462-475

JournalofFruitScience

DOI:10.13925/ki.gsxb

梨亚科5个属S-RNase基因的序列特征及进化分析

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梁文杰，谢志亮，乌云塔娜

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（温州科技职业学院，浙江温州325006；中国林业科学研究院经济林研究所，郑州450003）

摘要：【目的】分析梨亚科5个属S-RNase基因序列特征及其进化规律。【方法】收集GenBank数据库中5个属S-RNase

基因CDS全长、大于330bp的外显子片段以及内含子序列，剔除重复序列后，利用MEGA11软件对其进行序列和多态

性分析，并利用多序列比对结果构建系统进化树；计算S-RNase基因RSCU值，以欧式平方距离作为基因间进化距离

进行聚类分析。利用MEGA11软件计算梨亚科5个属S-RNase基因序列碱基组成及密码子使用偏好。【结果】GenBank

数据库中剔除重复序列后，共收录梨亚科5个属S-RNase基因CDS全长序列90条，长度范围为678~711bp；大于330bp

的外显子片段序列有140条。梨亚科5个属S-RNase基因序列各区域分析表明：C2-HV、C4-C5、C5-和HV区存在较多

的共性特征；编码区、内含子、密码子使用偏好聚类的进化树均没有明显种和属的界限。S-RNase基因3个位置的碱基

含量均呈现A+T大于C+G，HV区3个位置CG分布较为一致。【结论】梨亚科5个属S-RNase基因除了HV区，C2-HV、

C4-C5和C5-也具备参与S位点识别的可能性。同时，梨亚科5个属S-RNase基因的分化早于5个属的分化时间且S-

RNase基因密码子存在一定的偏好。

关键词：梨亚科；雌蕊S基因；序列特征；密码使用偏好；进化分析

中图分类号：S661.2文献标志码：A文章编号：1009-9980(2025)03-0462-14

SequencecharacterizationandevolutionaryanalysisofS-RNasegene

amongfivegeneraPomoideae

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LIANGWenjie,XIEZhiliang,WuyunTana

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(WenzhouVocationalCollegeofScienceandTechnology,Wenzhou325006,Zhejiang,China;ResearchInstituteofNon-TimberForest-

ryofChineseAcademyofForestry,Zhengzhou450003,Henan,China)

Abstract:【Objective】Inordertoavoidself-pollination,self-incompatibilityisacommonphenomenon

in5generainPyridaefruittreesduringevolution.Inordertounderstandthelatestisolationandidentifi-

cationofS-RNasegeneinpearincompatibility,weanalyzeditssequencecharacteristicsandev