赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区遗传多样性和进化分析.pdfVIP

2024年第60卷第10期科学技术

ScienceandTechnology·

赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区遗传多样性和

进化分析

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吴芸，李盼盼，闫吉美，杨凤，黄锡阳

（1.遵义师范学院生物与农业科技学院，贵州遵义563006；2.赤水市农业农村局畜牧渔业站，贵州赤水564700）

摘要：为探究赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区的遗传多样性、单倍型特征和母系起源情况，利用PCR扩增

和直接测序法检测了63只赤水乌骨鸡线粒体DNA（mitochondrialDNA,mtDNA）控制区（D-loop）全序

列，分析其遗传多样性和单倍型特性，并与不同红色原鸡亚种的序列进行聚类分析。结果表明，赤水乌骨鸡

mtDNAD-loop区全序列共检测到29个突变位点，构成19种单倍型。遗传多样性分析表明，单倍型多样性（Hd）、

核苷酸多样性（Pi）和平均核苷酸差异数（K）分别为0.9905±0.0180、0.0065±0.0005和7.981。系统发育

分析显示，赤水乌骨鸡19种单倍型可划分为A、B、C、E、G5个单倍型群，A、B均分别与原鸡滇南亚种聚类，

单倍型群C与原鸡印度亚种、原鸡滇南亚种和原鸡海南亚种聚为一类，E单倍型群分支与印度亚种和原鸡滇

南亚种聚为一类。据此推测，赤水乌骨鸡遗传多样性丰富，可能有多个母系起源，主要源于原鸡滇南亚种。

关键词：赤水乌骨鸡；mtDNA；控制区；遗传多样性；系统进化

中图分类号S831.2文献标识码ADOI编号10.19556/j.0258-703312

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mtDNA作为重要的遗传信息载体具有相对分子量是研究鸡品种的遗传信息以及种群内和种群间的系统发

低结构简单高拷贝数母系遗传无重组等特点育关系遗传距离和变异最重要的分子工具之一[7-8]

、、、、，、。

经常用于品种鉴定母系数量系统发育和地理起源分鸡肉是高效优质蛋白质来源养鸡生产对畜牧业发

、、，

析[1-2]mtDNAD-loop区是一段非编码区富含A/T碱展具有重要意义[9]地方鸡种是在我国独特的地理环境

。，。

基是mtDNA中进化速率最快的区域较线粒体其他和各异的风俗文化下形成的是现代养禽业重要的遗传

，，，

区域快5~10倍该区域具有高突变率和碱基替换的遗资源鸡的遗传多样性是其种质资源开发利用及可持

，。、

传特征其序列能为种群遗传多样性母系起源和进化续发展的重要依据近年来商业化的外来高产品种大

，、。