2025年大学《资源化学》专业题库—— 生物大分子相互作用的研究.docxVIP

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2025年大学《资源化学》专业题库——生物大分子相互作用的研究

考试时间:______分钟总分:______分姓名:______

一、简述生物大分子相互作用的基本驱动力和主要类型。请至少列举三种不同类型的相互作用,并简述其特点。

二、解释以下关键术语在生物大分子相互作用研究中的含义:亲和力常数(Kd)、结合位点数(n)、结合热(ΔH)、结合自由能(ΔG)。说明ΔG、ΔH和ΔS三者之间的关系及其对结合亲和力的影响。

三、紫外-可见吸收光谱和荧光光谱技术在研究蛋白质-配体相互作用中分别有哪些应用?请简述其基本原理,并说明各自的优势和局限性。

四、表面等离子共振(SPR)技术如何用于测定生物分子相互作用的亲和力常数和动力学参数(结合/解离速率常数)?请描述其基本原理,并说明其相对于其他方法(如放射性同位素标记)的优点。

五、分子动力学(MD)模拟在研究生物大分子相互作用中可以提供哪些信息?请举例说明MD模拟如何帮助理解蛋白质-蛋白质复合物的结合机制或蛋白质构象变化。

六、以生物矿化为例,详细描述生物大分子(如蛋白质、糖蛋白)如何调控无机物质的成核和晶体生长过程。请说明其中涉及的关键相互作用类型和可能的调控机制。

七、在酶催化反应中,酶与底物之间的相互作用至关重要。请阐述酶-底物相互作用遵循的“诱导契合”模型,并说明这种相互作用对酶催化效率(如Km和Vmax)的影响。

八、设计一个实验方案,用于研究一种未知蛋白质(ProteinX)与人造小分子配体(LigandY)之间的相互作用。请说明你将选择哪些研究方法(至少两种),并简述选择理由以及你将如何利用这些方法获得关于该相互作用的关键信息(如亲和力、结合模式、动力学参数)。同时,考虑该研究在开发新型资源化学品(如生物催化剂、生物传感器元件)方面的潜在应用。

九、生物传感器通常利用生物分子(如酶、抗体、适配体)与目标分析物之间的特异性相互作用来产生可测量的信号。请描述一种基于蛋白质-配体相互作用原理的生物传感器,说明其基本工作原理、关键组成部分以及可能的优化方向。

十、论述蛋白质-核酸相互作用在基因表达调控中的重要性。请选择一个具体的例子(如转录因子与DNA结合),描述其相互作用机制,并说明这种相互作用如何影响基因的转录活性。同时,简要讨论这种相互作用研究在生物能源开发(如设计高效的基因工程菌株)或环境监测(如检测特定DNA损伤)中的潜在应用价值。

试卷答案

一、

生物大分子相互作用的基本驱动力包括范德华力、静电相互作用、氢键、疏水作用、π-π堆积等非共价键力,以及可能的共价键作用。这些驱动力使得分子趋向于能量最低、熵增加的状态。主要类型包括:

1.蛋白质-蛋白质相互作用:如抗原-抗体、酶-底物、多蛋白复合物的形成,主要涉及疏水作用、范德华力、静电相互作用和氢键。特点是在界面处发生构象变化(诱导契合)。

2.蛋白质-核酸相互作用:如转录因子与DNA结合、翻译起始因子与mRNA结合,主要涉及碱基堆积、氢键和静电相互作用。特点是对序列和结构有高度特异性。

3.蛋白质-配体(小分子)相互作用:如激素与受体结合、酶抑制剂与酶结合,主要涉及氢键、静电相互作用和疏水作用。特点是对配体结构有高度特异性,通常结合位点较浅。

二、

亲和力常数(Kd):衡量生物分子间结合亲和力大小的指标,Kd值越小,表示结合越牢固。单位通常为摩尔浓度(mol/L)。

结合位点数(n):指一个生物大分子(通常是酶或受体)上结合配体的位点数量。n=1为单结合位点,n1为多结合位点。

结合热(ΔH):结合过程中释放或吸收的热量。ΔH0表示放热反应(通常为疏水作用和范德华力主导),ΔH0表示吸热反应(通常为氢键和静电作用主导)。

结合自由能(ΔG):结合过程中吉布斯自由能的变化。ΔG0表示结合是自发的,ΔG值越小,表示结合越自发性越强。ΔG与Kd的关系为ΔG=-RTln(Kd)。

ΔG、ΔH和ΔS三者关系为ΔG=ΔH-TΔS。结合亲和力与ΔG负相关。ΔH和ΔS共同决定ΔG的符号和大小。对于典型的生物分子结合,ΔH和ΔS通常具有相反的符号,且ΔH的绝对值往往大于|TΔS|。当ΔH0且-|ΔH||TΔS|时,ΔG通常为负,结合倾向于发生。

三、

紫外-可见(UV-Vis)光谱应用:

原理:利用配体或蛋白质在结合前后UV-Vis吸收光谱的变化(如特征峰位移、强度变化、新峰出现)来监测相互作用。常见的有紫外吸收猝灭(如Trp或Tyr残基被配体猝灭)和光诱导电子转移(FRET,需有供体和受体分子)。

优点:技术成熟、快速、成本相对较低、可检测大分子。

局限性:灵敏度和特异性相对较低,通常只能提供定性信息或间接定量(如通过摩尔消光系数变化),难以直接测定解离常数。

荧光光谱应用:

原理:利用

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