新型BET BD2抑制剂与两类共价抑制剂的设计、合成及活性的多维度探究.docxVIP

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新型BETBD2抑制剂与两类共价抑制剂的设计、合成及活性的多维度探究

一、引言

1.1BET蛋白概述

BET蛋白家族作为表观遗传学领域的关键调控因子,在生物体内发挥着不可或缺的作用。该家族包含四个异构体,分别为BRD2、BRD3、BRD4和BRDT。这四个成员在结构上具有显著的相似性,均含有两个在序列上高度保守的溴结构域(BD1、BD2)和一个超末端结构域(ET)。

溴结构域是BET蛋白识别并结合乙酰化赖氨酸(KAc)的关键元件,每个溴结构域由约110个氨基酸组成,通过特定的空间构象形成一个能够容纳乙酰化赖氨酸的疏水口袋。BD1和BD2虽然高度同源,但它们对乙酰化组蛋白肽靶序列的识别模式存在差异,这也决定了它们在生物学功能上可能具有不同的侧重点。超末端结构域(ET)则与多种辅助因子相互作用,进一步拓展了BET蛋白在细胞内的功能网络,参与调控基因转录、染色质重塑等重要的生物学过程。

在基因转录过程中,BET蛋白通过其溴结构域与染色质上乙酰化的赖氨酸残基紧密结合,从而将自身锚定在染色质特定区域。以BRD4为例,它能够招募正向转录延伸因子b(P-tefb),使P-tefb与靶基因转录区上的乙酰化组蛋白相结合。随后,P-tefb磷酸化RNA聚合酶Ⅱ(polⅡ)C端结构域的Brd4敏感性诱导因子和负性转录延伸因子,促使RNApolⅡ从近端启动子区域解离,解除负性延伸因子对转录的抑制作用,进而推动RNApolⅡ依赖性的基因转录过程,确保基因信息能够准确地从DNA传递到RNA,为后续蛋白质的合成提供模板。

在染色质重塑方面,BET蛋白的结合能够改变染色质的空间构象,影响染色质与其他转录调控因子的相互作用。当BET蛋白结合到染色质上时,它可以通过与其他染色质重塑复合物相互协作,调整核小体的位置和结构,使原本紧密缠绕的染色质变得更加松散,从而增加染色质对转录因子的可及性,促进基因的表达;或者反之,使染色质结构更加紧密,抑制基因的转录。这种对染色质结构的动态调控在细胞的分化、发育以及疾病的发生发展过程中都起着关键作用。

1.2BET蛋白与疾病的关联

BET蛋白在多种疾病的发生发展进程中扮演着关键角色,其异常表达或功能失调与肿瘤、炎症等疾病的发生发展密切相关。

在肿瘤领域,BET蛋白被发现对癌基因转录具有重要的调控作用。以BRD4为例,在急性髓系白血病(AML)中,转录因子会招募赖氨酸乙酰转移酶p300至染色质,使得染色质上的转录因子发生乙酰化修饰,而这些乙酰化的转录因子能够直接与BRD4结合,从而促使BRD4与AML基因组相结合。与此同时,BRD4还可以募集正向转录延伸因子b(P-tefb),P-tefb磷酸化RNA聚合酶Ⅱ以及暂停因子DSIF和NELF,从而促进转录伸长,推动肿瘤细胞的增殖与发展。在多发性骨髓瘤细胞中,Brd4与超级增强子(SEs)结合并将后者激活,促进细胞的恶性转化和肿瘤的进展,SEs还调控prdm1、c-myc、xbp1、irf4等基因表达,均促进了多发性骨髓瘤的发生发展。

在炎症疾病方面,BET蛋白参与调控炎症相关基因的表达。当机体受到炎症刺激时,BET蛋白会与炎症相关基因的启动子区域结合,促进这些基因的转录,导致炎症因子的释放增加,从而引发炎症反应。在类风湿性关节炎、炎症性肠病等炎症疾病中,都观察到BET蛋白的表达上调以及其对炎症反应的促进作用。

1.3BETBD2抑制剂研究现状

近年来,BET抑制剂的研究取得了显著进展,然而,目前大多数BET抑制剂对BD1和BD2具有相似的亲和活力,被称为泛BET抑制剂。虽然泛BET抑制剂在临床上展现出一定的抗癌和抗增殖活性,但也伴随着众多副作用,如胃肠道毒性和血小板减少等剂量限制性毒性。

由于BET蛋白家族四个亚型具有高度同源性,开发高亚型选择性的BET抑制剂极具挑战,但BD1和BD2间的同源性更低,使得开发高选择性BD2抑制剂成为可能。目前,已有一些BD2选择性BET抑制剂的研究报道。艾伯维公司开发的ABBV-744是第二代BD2高选择性BET抑制剂,其毒性低于泛BET抑制剂,并且在临床前体内模型中表现出稳定的药效,已进入临床试验用于治疗AML和骨髓纤维化。然而,有专利披露ABBV-744以低微摩尔浓度抑制hERG钾离子通道,有潜在的心血管疾病风险。中国科学院广州生物医药与健康研究院许永团队与中国药科大学吴筱星团队合作报道了一系列苯氧芳基吡啶酮作为高选择性BETBD2抑制剂用于AML的治疗,其中化合物23对BRD4BD2表现出强结合

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